44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4521 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4521  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  100 
 
 		 296 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.21 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  38.71 
 
 		 283 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2296  xylose isomerase domain-containing protein  38.21 
 
 		 284 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  0.299582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0501  xylose isomerase domain-containing protein  35.19 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.96 
 
 		 274 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5378  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.82 
 
 		 376 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.67 
 
 		 276 aa  49.3  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0622  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.38 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.86 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  27.65 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  27.51 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1485  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.41 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3575  xylose isomerase domain-containing protein  31.36 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0433  xylose isomerase domain-containing protein  21.54 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  22.73 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  24.28 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0323  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.77 
 
 		 536 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4822  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.97 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000375488  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3837  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.83 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  27.88 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.09 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.87 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  27.14 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  22.11 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  27.51 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  31.15 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0916  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.52 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  24.62 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  27.51 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.03 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal  0.2091 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  27.51 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3582  xylose isomerase domain-containing protein  28.67 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.744907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  28.3 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2721  xylose isomerase domain-containing protein  26.42 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543869  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  33.54 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  26.69 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3986  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.984461  normal  0.0421745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  32.23 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  29.84 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2503  hydroxypyruvate isomerase  24.58 
 
 		 264 aa  42.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1462  xylose isomerase-like  24.64 
 
 		 304 aa  42.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0792814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  24.48 
 
 		 280 aa  42.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  24.62 
 
 		 298 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>