66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS1962 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS1962  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  299  9e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.370718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2110  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  299  9e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2144  hypothetical protein  97.3 
 
 
148 aa  292  9e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1941  sugar phosphate isomerase/epimerase  95.27 
 
 
148 aa  289  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1917  sugar phosphate isomerase/epimerase  94.59 
 
 
148 aa  287  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2120  hypothetical protein  90.54 
 
 
269 aa  275  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.565953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3194  hypothetical protein  87.16 
 
 
269 aa  267  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0561892  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1682  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.11 
 
 
287 aa  77  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2191  hypothetical protein  96.67 
 
 
30 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000193377  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0086  xylose isomerase domain-containing protein  29.49 
 
 
334 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.64 
 
 
281 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0287  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  36.23 
 
 
290 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.61 
 
 
338 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.91 
 
 
332 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0121  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  31.88 
 
 
290 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0772  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  35.16 
 
 
290 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.692507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4079  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  34.07 
 
 
286 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03434  predicted L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  34.07 
 
 
286 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0132  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  34.07 
 
 
286 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.482678  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3905  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  34.07 
 
 
286 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4258  AP endonuclease  28.21 
 
 
292 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3786  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  34.07 
 
 
286 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03385  hypothetical protein  34.07 
 
 
286 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11150  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.25 
 
 
335 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.750375  normal  0.0940368 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0128  hexulose-6-phosphate isomerase  34.07 
 
 
286 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4100  AP endonuclease  28.21 
 
 
326 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03707  hypothetical protein  28.21 
 
 
326 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.95 
 
 
288 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5319  AP endonuclease, family 2  29.06 
 
 
326 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.44383 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4143  xylose isomerase domain-containing protein  28.21 
 
 
326 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03758  predicted sugar phosphate isomerase  28.21 
 
 
326 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4061  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  34.07 
 
 
286 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3999  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  34.07 
 
 
286 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.873782 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.21 
 
 
326 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4396  AP endonuclease  28.21 
 
 
326 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3874  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  34.07 
 
 
286 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3890  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  34.07 
 
 
286 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3954  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  34.07 
 
 
286 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2848  xylose isomerase-like TIM barrel  26.57 
 
 
282 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.561386  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10540  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.6 
 
 
333 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3581  xylose isomerase domain-containing protein  26.67 
 
 
325 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0249  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.77 
 
 
333 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4061  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.83 
 
 
334 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2300  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.62 
 
 
334 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5126  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.7 
 
 
376 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.764351  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3847  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24 
 
 
335 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0501  xylose isomerase domain-containing protein  24.56 
 
 
301 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5378  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.36 
 
 
376 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  24.24 
 
 
308 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1355  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.81 
 
 
335 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4275  normal  0.774655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1361  xylose isomerase domain-containing protein  28.07 
 
 
278 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0931  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  32.95 
 
 
293 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.298482 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3269  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  32.95 
 
 
293 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2721  xylose isomerase domain-containing protein  26.37 
 
 
280 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543869  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3402  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  32.95 
 
 
293 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.6 
 
 
333 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.09 
 
 
276 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.74 
 
 
280 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1909  xylose isomerase domain-containing protein  26.19 
 
 
333 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.32 
 
 
308 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2200  xylose isomerase domain-containing protein  30.68 
 
 
288 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0571  xylose isomerase domain-containing protein  26.19 
 
 
333 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1993  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  33.78 
 
 
287 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2335  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.91 
 
 
271 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  24.6 
 
 
335 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.33 
 
 
286 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>