81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2249 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2249  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  100 
 
 		 263 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4822  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.19 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000375488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0133  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.31 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1697  xylose isomerase domain-containing protein  39.42 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1040  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  40.94 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.384562  normal  0.731226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0456  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.13 
 
 		 308 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0916  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.55 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.93 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.69 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.79 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1971  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.8 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 843 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0435  xylose isomerase domain-containing protein  29.3 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.14 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.33 
 
 		 828 aa  88.2  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.68 
 
 		 280 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  33.83 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0323  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.09 
 
 		 536 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1988  petrobactin biosynthesis protein AsbF  24.35 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2296  xylose isomerase domain-containing protein  31.58 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  0.299582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3341  petrobactin biosynthesis protein AsbF  24.72 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.935338  hitchhiker  0.0000000000000165736 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1849  xylose isomerase domain-containing protein  23.99 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0568  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.8 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1817  hypothetical protein  22.88 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2021  petrobactin biosynthesis protein AsbF  22.88 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84806e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1843  hypothetical protein  22.88 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1986  hypothetical protein  22.88 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1800  hypothetical protein  22.88 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.07 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4058  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.52 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5488  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.27 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3700  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.3 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3763  xylose isomerase domain-containing protein  30.52 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.98 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0501  xylose isomerase domain-containing protein  30.18 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4202  hydroxypyruvate isomerase  40 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.78 
 
 		 282 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.1 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3955  xylose isomerase domain-containing protein  28.86 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00177251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4719  hydroxypyruvate isomerase  31.64 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1355  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.1 
 
 		 335 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4275  normal  0.774655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.35 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10540  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.14 
 
 		 333 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  24.81 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5126  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.09 
 
 		 376 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.19 
 
 		 333 aa  46.2  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4572  hydroxypyruvate isomerase  37.27 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6321  xylose isomerase domain-containing protein  28.7 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2298  xylose isomerase-like TIM barrel  29.85 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0572  hydroxypyruvate isomerase  23.76 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0567  hydroxypyruvate isomerase  23.76 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3837  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.66 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  36.36 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0565  hydroxypyruvate isomerase  23.76 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551663  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1508  xylose isomerase-like TIM barrel  28.7 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  23.95 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2721  xylose isomerase domain-containing protein  28.21 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543869  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.36 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.39 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.41 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0783  xylose isomerase-like TIM barrel  33.78 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15580  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.27 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4521  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  28.89 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3708  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.05 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6979  xylose isomerase domain-containing protein  29.57 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5868  xylose isomerase domain-containing protein  28.45 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.09 
 
 		 924 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.64 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72992  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  30.23 
 
 		 335 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  32.8 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3511  AP endonuclease  24.07 
 
 		 328 aa  42.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.17674 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0626  hydroxypyruvate isomerase  23.27 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.396658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4045  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.95 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2842  Hydroxypyruvate isomerase  31.82 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1158  hydroxypyruvate isomerase  29.78 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.671898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1842  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1232  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.77 
 
 		 279 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  hitchhiker  0.00338141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.31 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  25.91 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3847  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.43 
 
 		 335 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>