27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3314 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 279 aa  549  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0346457 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0778  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  63.44 
 
 		 280 aa  338  8e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0102757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0499  xylose isomerase domain-containing protein  60.93 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2335  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.59 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2200  xylose isomerase domain-containing protein  42.64 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0433  xylose isomerase domain-containing protein  28.81 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3837  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.86 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1444  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.27 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.87 
 
 		 280 aa  95.9  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4310  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.04 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1134  xylose isomerase domain-containing protein  30.09 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.155957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3626  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.86 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 843 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.17 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.87 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.06 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0500  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.63 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000106724  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2911  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.88 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28710  sugar phosphate isomerase/epimerase  22.86 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0885144  normal  0.0589318 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00560  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.49 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3593  xylose isomerase domain-containing protein  27.11 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  decreased coverage  0.000150106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2684  xylose isomerase domain-containing protein  26.67 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.11 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.89 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31660  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.67 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1971  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.61 
 
 		 265 aa  42.7  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.31 
 
 		 828 aa  42.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>