78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0476 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 262 aa  533  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  56.92 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.92 
 
 		 294 aa  295  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6143  xylose isomerase domain-containing protein  56 
 
 		 288 aa  290  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.536999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  54.55 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  55.51 
 
 		 272 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0340  xylose isomerase domain-containing protein  53.31 
 
 		 302 aa  279  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.57 
 
 		 312 aa  278  8e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  51.35 
 
 		 305 aa  275  6e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0407  xylose isomerase domain-containing protein  52.9 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  51.18 
 
 		 270 aa  272  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8356  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.45 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.16 
 
 		 287 aa  266  4e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18060  sugar phosphate isomerase/epimerase  52.34 
 
 		 295 aa  265  5.999999999999999e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5758  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  51.17 
 
 		 263 aa  258  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  50.79 
 
 		 278 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0835  xylose isomerase domain-containing protein  48 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0679  xylose isomerase domain-containing protein  46.91 
 
 		 281 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0666  xylose isomerase-like TIM barrel  46.91 
 
 		 281 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0077  xylose isomerase domain-containing protein  47.64 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0659  xylose isomerase domain-containing protein  46.91 
 
 		 281 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.748247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.42 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  50.95 
 
 		 265 aa  249  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  49.8 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.43 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10507  hypothetical protein  47.81 
 
 		 280 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0480257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.19 
 
 		 272 aa  241  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.33 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24530  sugar phosphate isomerase/epimerase  50.19 
 
 		 261 aa  237  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  48.44 
 
 		 266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.01 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  25.91 
 
 		 265 aa  72  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0975  xylose isomerase domain-containing protein  26.1 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000320481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0516  hypothetical protein  25.99 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0218037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.32 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000134824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1512  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.32 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2906  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.3 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.99 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.08 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  24.08 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  24.08 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  24.08 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  24.08 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  24.08 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4720  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.65 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  24.08 
 
 		 276 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  27.13 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  23.53 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  24.08 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  28.4 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.21 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.21 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.77 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1717  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.08 
 
 		 275 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3436  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.39 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  29.8 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  24.16 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  35.42 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  23.05 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  31.41 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  26.59 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  25.76 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5868  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  25.74 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  29.45 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.44 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4496  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.45 
 
 		 638 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4669  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.46 
 
 		 284 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104946  hitchhiker  0.000000014237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.74 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  28.21 
 
 		 323 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4691  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.65 
 
 		 284 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0121  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.9 
 
 		 290 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  21.61 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.38 
 
 		 276 aa  42  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31430  Xylose isomerase-like TIM barrel protein, probably inolved in myo-inositol catabolism  26.9 
 
 		 262 aa  42  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.161007  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3955  xylose isomerase domain-containing protein  36 
 
 		 276 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00177251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>