54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_18060 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_18060  sugar phosphate isomerase/epimerase  100 
 
 
295 aa  601  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  57.65 
 
 
278 aa  305  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  52.34 
 
 
294 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  52.34 
 
 
262 aa  265  8e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.28 
 
 
294 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  50.2 
 
 
308 aa  251  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24530  sugar phosphate isomerase/epimerase  54.51 
 
 
261 aa  250  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482145  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6143  xylose isomerase domain-containing protein  49.8 
 
 
288 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.536999  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  50.97 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0340  xylose isomerase domain-containing protein  50.78 
 
 
302 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  48.45 
 
 
305 aa  239  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  48.65 
 
 
272 aa  239  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0407  xylose isomerase domain-containing protein  50.78 
 
 
295 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8356  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.26 
 
 
305 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.51 
 
 
312 aa  231  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.62 
 
 
287 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  46.72 
 
 
270 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.25 
 
 
284 aa  225  8e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.7 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  49.22 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5758  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  46.54 
 
 
263 aa  212  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.84 
 
 
295 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0077  xylose isomerase domain-containing protein  43.27 
 
 
281 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10507  hypothetical protein  43.43 
 
 
280 aa  209  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0480257  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  45.04 
 
 
266 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0659  xylose isomerase domain-containing protein  42.91 
 
 
281 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.748247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0679  xylose isomerase domain-containing protein  42.91 
 
 
281 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0666  xylose isomerase-like TIM barrel  42.91 
 
 
281 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0835  xylose isomerase domain-containing protein  42.18 
 
 
281 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.38 
 
 
272 aa  202  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.66 
 
 
280 aa  193  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  27.98 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0975  xylose isomerase domain-containing protein  26.67 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000320481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0516  hypothetical protein  27.08 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0218037  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1512  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.12 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.12 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000134824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2906  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.14 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  24.14 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.62 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  24.62 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  24.62 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  24.62 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  24.62 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  24.62 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  24.62 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.91 
 
 
280 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  22.79 
 
 
257 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  22.73 
 
 
277 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.81 
 
 
258 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.61 
 
 
283 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.43 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.53 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.86 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.87 
 
 
480 aa  42.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>