39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0270 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  544  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  89.22 
 
 		 269 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  86.99 
 
 		 269 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  63.94 
 
 		 269 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  28.99 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  28 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  30.51 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.57 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1279  hypothetical protein  30.4 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.393575 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  23.88 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  26.86 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  24.4 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  24.06 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  24.05 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  24.4 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  23.11 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  23.31 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.26 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  24.45 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  23.31 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  21.94 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  24.59 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  24.18 
 
 		 287 aa  49.3  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  22.35 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  21.93 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  26.67 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.05 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  23.36 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  21.86 
 
 		 256 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  26.18 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  25.15 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.13 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.12 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4619  hypothetical protein  27.71 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00487202  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  27.39 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  21.96 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  20.85 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  21.37 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  22.36 
 
 		 253 aa  42  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>