52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0883 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 291 aa  588  1e-167  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  45.02 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  46.86 
 
 		 276 aa  257  1e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  45.99 
 
 		 279 aa  255  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  46.13 
 
 		 276 aa  255  7e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  46.61 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.96 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  40.36 
 
 		 273 aa  221  8e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  40.73 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  38.91 
 
 		 273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  38.55 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  37.45 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.15 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  40.15 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  40.15 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  36.43 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  37.5 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.19 
 
 		 276 aa  165  9e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  35.53 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  34.19 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  32.85 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  34.42 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  34.07 
 
 		 275 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  32.73 
 
 		 284 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.55 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.45 
 
 		 288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  32.61 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.77 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  29.66 
 
 		 315 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  25.1 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  25.1 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  25.1 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.81 
 
 		 264 aa  52.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  26.21 
 
 		 296 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.93 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  23.64 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  28.65 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  25.89 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  25.09 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  22.13 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  25.57 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  23.81 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  23.81 
 
 		 269 aa  45.8  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  22.87 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  26.17 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  25.63 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  26.11 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  24.4 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  21.89 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  23.55 
 
 		 282 aa  42.7  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  23 
 
 		 463 aa  42.7  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  23.29 
 
 		 253 aa  42.4  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>