86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2341 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  100 
 
 		 279 aa  566  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  57.66 
 
 		 298 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.37 
 
 		 276 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  48.7 
 
 		 276 aa  265  4e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  48.33 
 
 		 276 aa  265  7e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  45.99 
 
 		 291 aa  255  5e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  45.32 
 
 		 273 aa  248  6e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  44.6 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  48.36 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  42.09 
 
 		 276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  42.81 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  43.73 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.86 
 
 		 273 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  39.64 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  39.64 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  39.7 
 
 		 276 aa  175  8e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.24 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  36.26 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  34.81 
 
 		 280 aa  155  8e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  35.06 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  34.69 
 
 		 275 aa  149  7e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  34.18 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.77 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  33.46 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  33.21 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.11 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  33.21 
 
 		 287 aa  125  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.44 
 
 		 334 aa  99.8  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  28.86 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  32.79 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0264  apurinic endonuclease Apn1  30.77 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  25.24 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  25.63 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  25.63 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  25.63 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  23.76 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  28.22 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  23.35 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  26.82 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  25 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  23.39 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  25 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  24.02 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  25.81 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  24.49 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  25.46 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.17 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  25.7 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  26.46 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  23 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  28.37 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  24.54 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  25 
 
 		 295 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  21.79 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  22.66 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  24.2 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  25.81 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl333  endonuclease IV  24.04 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144036  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  25 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  22 
 
 		 256 aa  45.8  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3563  apurinic endonuclease Apn1  24.07 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587199 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  23.38 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  25.47 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  25.24 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  21.39 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  25.24 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  24.1 
 
 		 463 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  24.22 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  24.88 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  26.19 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  25.24 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  25.24 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  24.4 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  25.24 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  28.11 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  26.4 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  24.29 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  21.59 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  21 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  21.79 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  26.83 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  20.45 
 
 		 293 aa  42.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  23.15 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  24.28 
 
 		 279 aa  42.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0548  xylose isomerase domain-containing protein  25.6 
 
 		 276 aa  42.4  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000681576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>