35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0978 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  545  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  74.73 
 
 		 273 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  73.63 
 
 		 273 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  72.16 
 
 		 273 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  63.77 
 
 		 276 aa  358  6e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  44.04 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.73 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  43.73 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  40.36 
 
 		 291 aa  221  7e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  43.93 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  43.93 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  42.18 
 
 		 276 aa  215  7e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  41.73 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  42.06 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  35 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  33.69 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.64 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  35.23 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  35 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  34.64 
 
 		 284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  34.53 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  32.73 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.63 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  30.6 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  28.93 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.19 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.47 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  21.15 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  25.14 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  22.28 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  30.16 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  19.82 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  24.19 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>