108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1925 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 288 aa  601  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  55 
 
 		 292 aa  350  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.98 
 
 		 286 aa  311  5.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  50.55 
 
 		 284 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  41.75 
 
 		 287 aa  259  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  32.13 
 
 		 298 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  31.45 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  30.74 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  31.67 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  31.16 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  30.69 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  33.07 
 
 		 276 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  32.11 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.6 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  32.3 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.96 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  28.05 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  31.1 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  30.25 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  27.7 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  29.1 
 
 		 273 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  28.73 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  31.35 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  31.35 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  28.36 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  29.82 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  28.19 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.59 
 
 		 273 aa  95.5  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.85 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  29.55 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  26.2 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  27.37 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  27.37 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  25.79 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.1 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  21.92 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  21.92 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  21.92 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.23 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  29.1 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  25.78 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  22.52 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  24.75 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  24.31 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  25 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  23.2 
 
 		 304 aa  53.5  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  25.93 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  26.24 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  22.68 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  22.52 
 
 		 250 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  24.84 
 
 		 287 aa  52.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  24.88 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  24.88 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  24.88 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  27.16 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  24.88 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  22.05 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  24.39 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  23.04 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  23.42 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  24.88 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  25.48 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  24.88 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  24.88 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  24.41 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  24.41 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  24.41 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  23.46 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  25.47 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  23.41 
 
 		 284 aa  49.3  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  24.88 
 
 		 289 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  25.15 
 
 		 283 aa  49.3  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  34.69 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  23.75 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  23.77 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  24.54 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  24.14 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  23.4 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  24.73 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  22.08 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  28.07 
 
 		 287 aa  45.8  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  25.48 
 
 		 276 aa  45.8  0.0008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  24.31 
 
 		 283 aa  45.8  0.0009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  25.15 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  27.06 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  27.55 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  23.6 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  21.68 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  40 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  24.84 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  23.27 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  22.22 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  22.89 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  24.68 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  27.39 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  32.26 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  23.03 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  25.16 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  22.96 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  22.22 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>