42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1593 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  569  1e-161  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  88 
 
 		 280 aa  508  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  89.49 
 
 		 283 aa  504  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  84.73 
 
 		 275 aa  487  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  56.07 
 
 		 279 aa  323  2e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.87 
 
 		 276 aa  321  8e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  50.36 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  32.85 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.15 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  35.36 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  35.06 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  35 
 
 		 273 aa  147  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  33.45 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.54 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  33.09 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  31.29 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  32.37 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  32.36 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.69 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  31.62 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  31.62 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  31.34 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  30.86 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  30.32 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  30.32 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  33.21 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.42 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.84 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  26.32 
 
 		 315 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  25.96 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  21.08 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  26.14 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  28.74 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  25.87 
 
 		 286 aa  45.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  26.14 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  22.93 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  23.81 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  22.54 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  27.13 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  23.53 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  24.75 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  26.44 
 
 		 295 aa  42  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>