30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0637 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 334 aa  680    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  27.3 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.84 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  30.74 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  30.84 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  29.57 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  30.77 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  30.4 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  27.58 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  31.2 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  32.87 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  28.44 
 
 		 279 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  24.62 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  24.61 
 
 		 276 aa  92.8  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  25.67 
 
 		 276 aa  92.4  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  24.92 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  24.92 
 
 		 276 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.17 
 
 		 273 aa  89.4  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  27.73 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.85 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  27.11 
 
 		 250 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  24.32 
 
 		 273 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  26.58 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.2 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.09 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  27.47 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  28.83 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  26.92 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  26.76 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  29.89 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>