52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1958 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  100 
 
 		 321 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0352  putative UV damage endonuclease  55.31 
 
 		 320 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0226  putative UV damage endonuclease  41.12 
 
 		 320 aa  275  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0261  putative UV damage endonuclease  40.81 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0220  putative UV damage endonuclease  40.81 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09690  UV-damage endonuclease  43.38 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0282  putative UV damage endonuclease  40.81 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0234  putative UV damage endonuclease  40.5 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0248  putative UV damage endonuclease  40.5 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0268  putative UV damage endonuclease  40.19 
 
 		 320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5031  putative UV damage endonuclease  43.04 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5196  putative UV damage endonuclease  42.72 
 
 		 325 aa  266  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5482  putative UV damage endonuclease  42.36 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00076695  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5047  putative UV damage endonuclease  43.04 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.43469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0222  putative UV damage endonuclease  40.5 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5061  putative UV damage endonuclease  40.19 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0263  putative UV damage endonuclease  40.5 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5440  putative UV damage endonuclease  42.72 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5592  putative UV damage endonuclease  42.41 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5478  putative UV damage endonuclease  43.04 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5525  putative UV damage endonuclease  42.41 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5470  putative UV damage endonuclease  43.31 
 
 		 317 aa  262  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000392021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5145  putative UV damage endonuclease  41.77 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1722  putative UV damage endonuclease  34.88 
 
 		 301 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1346  putative UV damage endonuclease  34.83 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00604  endonuclease (Eurofung)  33.45 
 
 		 591 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2043  putative UV damage endonuclease  32.34 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2329  putative UV damage endonuclease  32.2 
 
 		 412 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.385133  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  30.46 
 
 		 418 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  32.84 
 
 		 420 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.295167 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2026  UV-endonuclease UvdE  34.95 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200241  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03600  conserved hypothetical protein  33.07 
 
 		 612 aa  157  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.574638  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2424  UV-endonuclease UvdE  34.19 
 
 		 353 aa  152  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0174  putative UV damage endonuclease  30.8 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1671  putative UV damage endonuclease  29.67 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00771336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0136  putative UV damage endonuclease  33.18 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0573  putative UV damage endonuclease  27.15 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280192  normal  0.431721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2305  UV-endonuclease UvdE  27.34 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3025  putative UV damage endonuclease  26.86 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4123  putative UV damage endonuclease  26.62 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1819  putative UV damage endonuclease  25.98 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.594158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0383  UV damage repair endonuclease-like protein  22.56 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0127865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1707  UV damage repair endonuclease  24.8 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1694  UV damage repair endonuclease-like protein  26.74 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1816  UV damage repair endonuclease  23.95 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2133  UV damage repair endonuclease  24.44 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  0.466844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1536  UV damage repair endonuclease  24.39 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6817  UV damage repair endonuclease  23.17 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2319  UV damage repair endonuclease-like protein  24.28 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.86 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3654  UV damage repair endonuclease-like protein  21.76 
 
 		 299 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1775  hypothetical protein  33.8 
 
 		 57 aa  49.3  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000133943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>