50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0136 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0136  putative UV damage endonuclease  100 
 
 		 225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0174  putative UV damage endonuclease  62.16 
 
 		 296 aa  291  8e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1346  putative UV damage endonuclease  53.85 
 
 		 306 aa  258  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5482  putative UV damage endonuclease  33.18 
 
 		 317 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00076695  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5470  putative UV damage endonuclease  33.18 
 
 		 317 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000392021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  33.18 
 
 		 321 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5145  putative UV damage endonuclease  32.72 
 
 		 317 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5196  putative UV damage endonuclease  32.13 
 
 		 325 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5031  putative UV damage endonuclease  32.13 
 
 		 317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5525  putative UV damage endonuclease  32.72 
 
 		 325 aa  134  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5440  putative UV damage endonuclease  31.67 
 
 		 325 aa  134  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5047  putative UV damage endonuclease  32.26 
 
 		 325 aa  134  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.43469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09690  UV-damage endonuclease  32.87 
 
 		 309 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1722  putative UV damage endonuclease  36.68 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5478  putative UV damage endonuclease  32.26 
 
 		 317 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03600  conserved hypothetical protein  39.3 
 
 		 612 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.574638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5592  putative UV damage endonuclease  31.67 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0352  putative UV damage endonuclease  33.33 
 
 		 320 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00604  endonuclease (Eurofung)  36.44 
 
 		 591 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0248  putative UV damage endonuclease  30.97 
 
 		 320 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0226  putative UV damage endonuclease  31.42 
 
 		 320 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0282  putative UV damage endonuclease  30.97 
 
 		 320 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0220  putative UV damage endonuclease  30.97 
 
 		 320 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0234  putative UV damage endonuclease  30.97 
 
 		 320 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0261  putative UV damage endonuclease  30.97 
 
 		 320 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0268  putative UV damage endonuclease  30.53 
 
 		 320 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0222  putative UV damage endonuclease  30.97 
 
 		 320 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5061  putative UV damage endonuclease  31.34 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0263  putative UV damage endonuclease  31.34 
 
 		 320 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  36.84 
 
 		 420 aa  109  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.295167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0573  putative UV damage endonuclease  35.1 
 
 		 315 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280192  normal  0.431721 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2026  UV-endonuclease UvdE  36.28 
 
 		 311 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2305  UV-endonuclease UvdE  34.35 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  33.65 
 
 		 418 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1671  putative UV damage endonuclease  34.31 
 
 		 321 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00771336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2424  UV-endonuclease UvdE  30.84 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4123  putative UV damage endonuclease  31.43 
 
 		 308 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3025  putative UV damage endonuclease  32.09 
 
 		 298 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2043  putative UV damage endonuclease  31.03 
 
 		 412 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2329  putative UV damage endonuclease  30.34 
 
 		 412 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.385133  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1819  putative UV damage endonuclease  31.82 
 
 		 311 aa  86.3  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.594158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1816  UV damage repair endonuclease  32.32 
 
 		 364 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1536  UV damage repair endonuclease  32.32 
 
 		 364 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0383  UV damage repair endonuclease-like protein  29.34 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0127865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1707  UV damage repair endonuclease  30.73 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6817  UV damage repair endonuclease  27.98 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2133  UV damage repair endonuclease  28.03 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  0.466844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3654  UV damage repair endonuclease-like protein  31.78 
 
 		 299 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1694  UV damage repair endonuclease-like protein  26.38 
 
 		 313 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2319  UV damage repair endonuclease-like protein  24 
 
 		 312 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  0.953856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>