48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1707 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1536  UV damage repair endonuclease  93.68 
 
 		 364 aa  692    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1707  UV damage repair endonuclease  100 
 
 		 363 aa  734    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1816  UV damage repair endonuclease  93.41 
 
 		 364 aa  691    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6817  UV damage repair endonuclease  69.6 
 
 		 355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2133  UV damage repair endonuclease  67.35 
 
 		 357 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  0.466844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5482  putative UV damage endonuclease  28.46 
 
 		 317 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00076695  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5031  putative UV damage endonuclease  28.71 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5145  putative UV damage endonuclease  29.15 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5440  putative UV damage endonuclease  28.71 
 
 		 325 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5196  putative UV damage endonuclease  28.71 
 
 		 325 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5047  putative UV damage endonuclease  28.71 
 
 		 325 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.43469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5478  putative UV damage endonuclease  28.5 
 
 		 317 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5470  putative UV damage endonuclease  28.46 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000392021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5592  putative UV damage endonuclease  28.71 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5525  putative UV damage endonuclease  28.02 
 
 		 325 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1346  putative UV damage endonuclease  24.72 
 
 		 306 aa  90.5  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09690  UV-damage endonuclease  23.38 
 
 		 309 aa  86.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1722  putative UV damage endonuclease  30.1 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0226  putative UV damage endonuclease  27.64 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0573  putative UV damage endonuclease  27.54 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280192  normal  0.431721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0263  putative UV damage endonuclease  27.64 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2329  putative UV damage endonuclease  24.23 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.385133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5061  putative UV damage endonuclease  27.64 
 
 		 320 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0282  putative UV damage endonuclease  27.64 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2026  UV-endonuclease UvdE  32.18 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2305  UV-endonuclease UvdE  31.34 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2043  putative UV damage endonuclease  25.26 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0222  putative UV damage endonuclease  27.64 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0268  putative UV damage endonuclease  27.64 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  24.8 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  26.89 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0220  putative UV damage endonuclease  27.64 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0234  putative UV damage endonuclease  27.64 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0261  putative UV damage endonuclease  27.64 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0248  putative UV damage endonuclease  27.64 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0174  putative UV damage endonuclease  25.45 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4123  putative UV damage endonuclease  24.53 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0352  putative UV damage endonuclease  27.49 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03600  conserved hypothetical protein  31.48 
 
 		 612 aa  74.3  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.574638  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  25.33 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.295167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1671  putative UV damage endonuclease  28.08 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00771336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3025  putative UV damage endonuclease  25.86 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.844821 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00604  endonuclease (Eurofung)  28.05 
 
 		 591 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0136  putative UV damage endonuclease  30.73 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1819  putative UV damage endonuclease  27.44 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.594158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2424  UV-endonuclease UvdE  26.5 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1694  UV damage repair endonuclease-like protein  32.73 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2319  UV damage repair endonuclease-like protein  31.17 
 
 		 312 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  0.953856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>