46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2133 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2133  UV damage repair endonuclease  100 
 
 		 357 aa  717    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  0.466844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6817  UV damage repair endonuclease  68.8 
 
 		 355 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1707  UV damage repair endonuclease  67.05 
 
 		 363 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1536  UV damage repair endonuclease  66.76 
 
 		 364 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1816  UV damage repair endonuclease  66.76 
 
 		 364 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5145  putative UV damage endonuclease  27.27 
 
 		 317 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5482  putative UV damage endonuclease  25.69 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00076695  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5470  putative UV damage endonuclease  24.85 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000392021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5440  putative UV damage endonuclease  23.55 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5047  putative UV damage endonuclease  24.65 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.43469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5196  putative UV damage endonuclease  23.24 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5031  putative UV damage endonuclease  23.24 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5478  putative UV damage endonuclease  25 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5592  putative UV damage endonuclease  24.65 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5525  putative UV damage endonuclease  23.24 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1346  putative UV damage endonuclease  26.07 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0174  putative UV damage endonuclease  27.65 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03600  conserved hypothetical protein  33.01 
 
 		 612 aa  84  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.574638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0226  putative UV damage endonuclease  28.71 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5061  putative UV damage endonuclease  28.71 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1671  putative UV damage endonuclease  30.72 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00771336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0263  putative UV damage endonuclease  27.72 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09690  UV-damage endonuclease  25.58 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0282  putative UV damage endonuclease  28.84 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0268  putative UV damage endonuclease  28.84 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0261  putative UV damage endonuclease  28.84 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  24.14 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0234  putative UV damage endonuclease  28.84 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0220  putative UV damage endonuclease  28.84 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0248  putative UV damage endonuclease  28.84 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0222  putative UV damage endonuclease  28.84 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0352  putative UV damage endonuclease  25.99 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2329  putative UV damage endonuclease  22.61 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.385133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2305  UV-endonuclease UvdE  29.85 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1722  putative UV damage endonuclease  29.34 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2043  putative UV damage endonuclease  22.11 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4123  putative UV damage endonuclease  25.3 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2026  UV-endonuclease UvdE  33.99 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200241  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00604  endonuclease (Eurofung)  26.22 
 
 		 591 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  34.81 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.295167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0573  putative UV damage endonuclease  21.63 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280192  normal  0.431721 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  25.97 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3025  putative UV damage endonuclease  24.07 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0136  putative UV damage endonuclease  27.64 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1819  putative UV damage endonuclease  28.84 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.594158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2424  UV-endonuclease UvdE  27.94 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>