50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0352 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0352  putative UV damage endonuclease  100 
 
 		 320 aa  656    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  55.31 
 
 		 321 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5145  putative UV damage endonuclease  44.2 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5482  putative UV damage endonuclease  43.57 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00076695  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5031  putative UV damage endonuclease  43.89 
 
 		 317 aa  276  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5196  putative UV damage endonuclease  43.57 
 
 		 325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5047  putative UV damage endonuclease  43.26 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.43469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5440  putative UV damage endonuclease  43.57 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5470  putative UV damage endonuclease  43.89 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000392021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0263  putative UV damage endonuclease  44.38 
 
 		 320 aa  272  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5592  putative UV damage endonuclease  43.57 
 
 		 325 aa  272  7e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5478  putative UV damage endonuclease  42.95 
 
 		 317 aa  271  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5061  putative UV damage endonuclease  44.06 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09690  UV-damage endonuclease  42.19 
 
 		 309 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5525  putative UV damage endonuclease  42.32 
 
 		 325 aa  268  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0222  putative UV damage endonuclease  43.75 
 
 		 320 aa  268  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0261  putative UV damage endonuclease  43.44 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0220  putative UV damage endonuclease  43.44 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0226  putative UV damage endonuclease  43.75 
 
 		 320 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0282  putative UV damage endonuclease  43.44 
 
 		 320 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0248  putative UV damage endonuclease  43.44 
 
 		 320 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0234  putative UV damage endonuclease  43.44 
 
 		 320 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0268  putative UV damage endonuclease  42.81 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2043  putative UV damage endonuclease  33.89 
 
 		 412 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1722  putative UV damage endonuclease  35 
 
 		 301 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2329  putative UV damage endonuclease  32.54 
 
 		 412 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.385133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0174  putative UV damage endonuclease  32.37 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1346  putative UV damage endonuclease  34.59 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2026  UV-endonuclease UvdE  37.04 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200241  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00604  endonuclease (Eurofung)  32.55 
 
 		 591 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  33.84 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.295167 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  30.98 
 
 		 418 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03600  conserved hypothetical protein  32.64 
 
 		 612 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.574638  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2424  UV-endonuclease UvdE  32.58 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1671  putative UV damage endonuclease  31.33 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00771336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2305  UV-endonuclease UvdE  31 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0136  putative UV damage endonuclease  33.33 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0573  putative UV damage endonuclease  31.01 
 
 		 315 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280192  normal  0.431721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4123  putative UV damage endonuclease  29.22 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3025  putative UV damage endonuclease  25 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6817  UV damage repair endonuclease  30.94 
 
 		 355 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0383  UV damage repair endonuclease-like protein  26.72 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0127865  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1819  putative UV damage endonuclease  27.99 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.594158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1707  UV damage repair endonuclease  27.49 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1816  UV damage repair endonuclease  26.67 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1536  UV damage repair endonuclease  26.67 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2133  UV damage repair endonuclease  25.99 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  0.466844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1694  UV damage repair endonuclease-like protein  27.96 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2319  UV damage repair endonuclease-like protein  28.21 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3654  UV damage repair endonuclease-like protein  23.83 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000592118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>