56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3012 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  100 
 
 		 420 aa  856    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.295167 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  45.86 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2043  putative UV damage endonuclease  34.68 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2329  putative UV damage endonuclease  34.68 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.385133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1722  putative UV damage endonuclease  38.49 
 
 		 301 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2026  UV-endonuclease UvdE  37.54 
 
 		 311 aa  176  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09690  UV-damage endonuclease  31.34 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  32.84 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0282  putative UV damage endonuclease  31.65 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0268  putative UV damage endonuclease  30.98 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0226  putative UV damage endonuclease  30.82 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5061  putative UV damage endonuclease  31.65 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0261  putative UV damage endonuclease  30.98 
 
 		 320 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0248  putative UV damage endonuclease  30.98 
 
 		 320 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0234  putative UV damage endonuclease  30.98 
 
 		 320 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0220  putative UV damage endonuclease  30.98 
 
 		 320 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0263  putative UV damage endonuclease  31.65 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5482  putative UV damage endonuclease  30.19 
 
 		 317 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00076695  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0222  putative UV damage endonuclease  30.98 
 
 		 320 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1671  putative UV damage endonuclease  34.93 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00771336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5145  putative UV damage endonuclease  31.87 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5525  putative UV damage endonuclease  30.39 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0352  putative UV damage endonuclease  33.84 
 
 		 320 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5470  putative UV damage endonuclease  29.37 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000392021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5440  putative UV damage endonuclease  30.07 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5031  putative UV damage endonuclease  29.74 
 
 		 317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5478  putative UV damage endonuclease  30.39 
 
 		 317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5196  putative UV damage endonuclease  29.74 
 
 		 325 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5047  putative UV damage endonuclease  29.74 
 
 		 325 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.43469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5592  putative UV damage endonuclease  29.74 
 
 		 325 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2424  UV-endonuclease UvdE  32.04 
 
 		 353 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1346  putative UV damage endonuclease  30.71 
 
 		 306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03600  conserved hypothetical protein  32.82 
 
 		 612 aa  123  6e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.574638  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00604  endonuclease (Eurofung)  30.77 
 
 		 591 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2305  UV-endonuclease UvdE  32.77 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0174  putative UV damage endonuclease  40.33 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4123  putative UV damage endonuclease  31.11 
 
 		 308 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3025  putative UV damage endonuclease  32 
 
 		 298 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0136  putative UV damage endonuclease  36.84 
 
 		 225 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0573  putative UV damage endonuclease  29.15 
 
 		 315 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280192  normal  0.431721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1694  UV damage repair endonuclease-like protein  33.33 
 
 		 313 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1819  putative UV damage endonuclease  32.82 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.594158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2319  UV damage repair endonuclease-like protein  35.41 
 
 		 312 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0383  UV damage repair endonuclease-like protein  30.04 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0127865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1707  UV damage repair endonuclease  26.44 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1816  UV damage repair endonuclease  28.9 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1536  UV damage repair endonuclease  28.9 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6817  UV damage repair endonuclease  31.05 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2133  UV damage repair endonuclease  34.81 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  0.466844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3654  UV damage repair endonuclease-like protein  25.64 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0888  hypothetical protein  30.97 
 
 		 123 aa  54.7  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0151823  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1969  hypothetical protein  35.65 
 
 		 125 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000668249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1775  hypothetical protein  38.57 
 
 		 57 aa  53.5  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000133943  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2450  hypothetical protein  33.91 
 
 		 127 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2404  hypothetical protein  33.91 
 
 		 127 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0795  hypothetical protein  29.31 
 
 		 128 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0070553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>