58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0888 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0888  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  251  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0151823  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0795  hypothetical protein  55.17 
 
 		 128 aa  130  7.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0070553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2450  hypothetical protein  38.26 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2404  hypothetical protein  38.26 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1969  hypothetical protein  39.13 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000668249  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  38.46 
 
 		 418 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  39.39 
 
 		 319 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  30.63 
 
 		 323 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  25.45 
 
 		 323 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  30.56 
 
 		 332 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  31.25 
 
 		 316 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  33.33 
 
 		 319 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2547  hypothetical protein  36.49 
 
 		 322 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  39.68 
 
 		 322 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  39.68 
 
 		 322 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  39.68 
 
 		 322 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  39.68 
 
 		 322 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1297  hypothetical protein  27.43 
 
 		 307 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  39.68 
 
 		 322 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  30 
 
 		 315 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  36.49 
 
 		 322 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  31.75 
 
 		 317 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0974  hypothetical protein  26.72 
 
 		 175 aa  45.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186024 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  38.1 
 
 		 322 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  38.1 
 
 		 322 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  38.1 
 
 		 322 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  36.51 
 
 		 316 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  30.97 
 
 		 420 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.295167 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2929  Protein of unknown function DUF1722  30.26 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  25.6 
 
 		 339 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0624  hypothetical protein  30.26 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  26.61 
 
 		 370 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0754  hypothetical protein  30.26 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0760675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00667  hypothetical protein  29.41 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2948  hypothetical protein  29.41 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0572605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00656  hypothetical protein  29.41 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0732  hypothetical protein  29.41 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  38.6 
 
 		 316 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0797  hypothetical protein  30.88 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  33.33 
 
 		 319 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  30.7 
 
 		 316 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  28.57 
 
 		 317 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  27.19 
 
 		 316 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  28.57 
 
 		 319 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  33.33 
 
 		 319 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  35.14 
 
 		 316 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  33.33 
 
 		 319 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  33.33 
 
 		 319 aa  40.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  33.82 
 
 		 322 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  33.33 
 
 		 319 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  28.18 
 
 		 315 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0722  hypothetical protein  30.16 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.302586  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  25 
 
 		 322 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  31.75 
 
 		 319 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  27.27 
 
 		 327 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  25.42 
 
 		 322 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  25 
 
 		 322 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>