28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1969 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1969  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  259  8e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000668249  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2450  hypothetical protein  53.6 
 
 
127 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2404  hypothetical protein  53.6 
 
 
127 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0888  hypothetical protein  39.13 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0151823  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0795  hypothetical protein  35.77 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0070553  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  28.21 
 
 
332 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0412  Protein of unknown function DUF1722  25.2 
 
 
308 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000671457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  26.4 
 
 
322 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  26.4 
 
 
322 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  26.4 
 
 
322 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  27.42 
 
 
316 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  38.81 
 
 
322 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  38.81 
 
 
322 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  38.81 
 
 
322 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  38.81 
 
 
322 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1297  hypothetical protein  34.88 
 
 
307 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  38.81 
 
 
322 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  38.81 
 
 
322 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  28.23 
 
 
316 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  26.4 
 
 
322 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  37.31 
 
 
322 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  37.31 
 
 
322 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  25.58 
 
 
315 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2547  hypothetical protein  37.31 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  32.43 
 
 
316 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  37.31 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  30.49 
 
 
324 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  35.65 
 
 
420 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.295167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>