184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1034 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  100 
 
 
316 aa  651    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  96.2 
 
 
316 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  73.8 
 
 
323 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  71.66 
 
 
316 aa  471  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  69.94 
 
 
315 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  58.33 
 
 
314 aa  381  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  57.37 
 
 
323 aa  378  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  57.59 
 
 
324 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  56.01 
 
 
316 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  57.68 
 
 
370 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  58.97 
 
 
316 aa  360  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  54.19 
 
 
315 aa  352  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  56.44 
 
 
335 aa  352  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  52.87 
 
 
316 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  51.12 
 
 
311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  49.2 
 
 
319 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  50.31 
 
 
318 aa  301  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  49.69 
 
 
318 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  49.84 
 
 
319 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  48.87 
 
 
318 aa  295  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.728517 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1208  hypothetical protein  48.4 
 
 
326 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.569232  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  47.76 
 
 
332 aa  285  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  46.13 
 
 
316 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  45.86 
 
 
320 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  44.41 
 
 
322 aa  269  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1164  hypothetical protein  44.84 
 
 
317 aa  268  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1163  hypothetical protein  44.52 
 
 
317 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  44.52 
 
 
317 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  44.52 
 
 
318 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3386  hypothetical protein  45.16 
 
 
317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1123  hypothetical protein  43.55 
 
 
318 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  45.19 
 
 
322 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0865  hypothetical protein  42.26 
 
 
314 aa  264  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3039  hypothetical protein  44.84 
 
 
320 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  44.55 
 
 
322 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0963  hypothetical protein  42.58 
 
 
318 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  44.55 
 
 
322 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  45.08 
 
 
319 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  44.09 
 
 
319 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  45.43 
 
 
316 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  44.19 
 
 
317 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  44.19 
 
 
317 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  44.59 
 
 
316 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  44.19 
 
 
317 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  44.19 
 
 
317 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  43.87 
 
 
320 aa  258  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  43.23 
 
 
317 aa  258  9e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  41.99 
 
 
318 aa  258  9e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  44.79 
 
 
314 aa  256  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  44.23 
 
 
322 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  42.81 
 
 
324 aa  255  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  44.9 
 
 
326 aa  255  8e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  43.55 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0852  hypothetical protein  68.39 
 
 
186 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0139574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  42.09 
 
 
317 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3010  hypothetical protein  42.09 
 
 
315 aa  248  7e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  44.9 
 
 
314 aa  248  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  39.24 
 
 
326 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  44.03 
 
 
317 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  40.33 
 
 
315 aa  245  6e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1610  protein of unknown function DUF1722  40.32 
 
 
321 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  43.45 
 
 
319 aa  245  9e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4454  protein of unknown function DUF523  42.81 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  42.63 
 
 
319 aa  242  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  42.58 
 
 
318 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  42.58 
 
 
319 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  41.38 
 
 
319 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  40.84 
 
 
319 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  41.43 
 
 
319 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  40.13 
 
 
319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  40.13 
 
 
319 aa  225  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  40.13 
 
 
319 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  40.13 
 
 
319 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  40.13 
 
 
319 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  39.05 
 
 
332 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  42.81 
 
 
319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41400  hypothetical protein  42.86 
 
 
317 aa  218  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.476626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4334  protein of unknown function DUF523  38.71 
 
 
327 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.928853  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1150  protein of unknown function DUF523  37.3 
 
 
315 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.441382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04980  hypothetical protein  34.5 
 
 
324 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  34.42 
 
 
339 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  35.69 
 
 
322 aa  188  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0716  Protein of unknown function DUF1722  32.79 
 
 
311 aa  188  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000994738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  35.69 
 
 
322 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  36.33 
 
 
322 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  35.37 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  35.37 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  35.37 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  35.37 
 
 
322 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  35.37 
 
 
322 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2547  hypothetical protein  34.73 
 
 
322 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  34.73 
 
 
322 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  32.37 
 
 
327 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2274  hypothetical protein  35.28 
 
 
334 aa  176  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0380  hypothetical protein  30.49 
 
 
322 aa  176  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1381  protein of unknown function DUF523  34.64 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1601  hypothetical protein  29.84 
 
 
322 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0115069  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0412  Protein of unknown function DUF1722  30.03 
 
 
308 aa  172  5.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000671457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  32.91 
 
 
316 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0311  hypothetical protein  29.84 
 
 
322 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>