188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4734 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1123  hypothetical protein  76.6 
 
 		 318 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0963  hypothetical protein  75.64 
 
 		 318 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  75.88 
 
 		 316 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  69.18 
 
 		 322 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  68.32 
 
 		 322 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  67.61 
 
 		 322 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  67.3 
 
 		 322 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41400  hypothetical protein  66.77 
 
 		 317 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.476626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  57.05 
 
 		 319 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  55.14 
 
 		 318 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  51.09 
 
 		 332 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1208  hypothetical protein  52.06 
 
 		 326 aa  335  7.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.569232  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  48.12 
 
 		 318 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  46.54 
 
 		 318 aa  308  5.9999999999999995e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  49.35 
 
 		 317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  48.06 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  48.87 
 
 		 317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  48.06 
 
 		 317 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3386  hypothetical protein  47.74 
 
 		 317 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  48.06 
 
 		 317 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  48.06 
 
 		 317 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1163  hypothetical protein  47.74 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  48.06 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1164  hypothetical protein  48.06 
 
 		 317 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  47.74 
 
 		 317 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  48.06 
 
 		 320 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  47.52 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3039  hypothetical protein  44.72 
 
 		 320 aa  288  8e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  46.37 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  46.98 
 
 		 314 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  46.44 
 
 		 316 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  44.23 
 
 		 311 aa  282  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  46.73 
 
 		 370 aa  281  9e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  44.9 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  44.73 
 
 		 314 aa  278  6e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  44.87 
 
 		 319 aa  278  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  44.69 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  44.69 
 
 		 318 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  45.09 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  44.73 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  44.44 
 
 		 319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  45.86 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  44.84 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  44.37 
 
 		 319 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  45.63 
 
 		 317 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  45.86 
 
 		 316 aa  271  9e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  42.45 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  43.69 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3010  hypothetical protein  42.68 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  43.49 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0865  hypothetical protein  40.65 
 
 		 314 aa  266  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  43.81 
 
 		 319 aa  265  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  42.58 
 
 		 316 aa  262  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  43.45 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  42.63 
 
 		 319 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  44.23 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  41.4 
 
 		 317 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  42.58 
 
 		 316 aa  259  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  44.87 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  46.5 
 
 		 316 aa  258  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  41.21 
 
 		 318 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.728517 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  41.32 
 
 		 319 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  43.77 
 
 		 315 aa  255  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  41.01 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  41.01 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  41.01 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  41.01 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  40.69 
 
 		 319 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  43.41 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  40.06 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  41.8 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1610  protein of unknown function DUF1722  38.14 
 
 		 321 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4454  protein of unknown function DUF523  37.69 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4334  protein of unknown function DUF523  38.14 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.928853  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  35.08 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  35.02 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  35.48 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1150  protein of unknown function DUF523  33.23 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.441382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  32.8 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  33.55 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  33.55 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  33.55 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0716  Protein of unknown function DUF1722  31.39 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000994738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  33.55 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1601  hypothetical protein  31.82 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0115069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  33.55 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  33.55 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  33.55 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2547  hypothetical protein  33.23 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  33.55 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  33.23 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04980  hypothetical protein  30.94 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0536  hypothetical protein  30.67 
 
 		 322 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.037048  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0380  hypothetical protein  30.62 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0412  Protein of unknown function DUF1722  29.87 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000671457  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0311  hypothetical protein  30.35 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  29.32 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2274  hypothetical protein  32.8 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0852  hypothetical protein  47.13 
 
 		 186 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0139574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>