215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1223 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  659    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  94.98 
 
 		 319 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  76.8 
 
 		 317 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  77.74 
 
 		 319 aa  512  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  76.75 
 
 		 317 aa  510  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  60.19 
 
 		 319 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  61.08 
 
 		 319 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  60.84 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  60.84 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  60.84 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  60.84 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  60.52 
 
 		 319 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  60.84 
 
 		 319 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  60.52 
 
 		 319 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  55.87 
 
 		 322 aa  355  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0865  hypothetical protein  52.38 
 
 		 314 aa  345  6e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  52.55 
 
 		 317 aa  345  8e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  53.97 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  52.55 
 
 		 317 aa  342  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1163  hypothetical protein  52.23 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1164  hypothetical protein  52.55 
 
 		 317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  51.59 
 
 		 317 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  51.59 
 
 		 317 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  51.59 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  51.27 
 
 		 317 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3386  hypothetical protein  51.59 
 
 		 317 aa  335  5e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  52.7 
 
 		 316 aa  334  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3039  hypothetical protein  49.36 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  50.32 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  51.11 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  49.53 
 
 		 314 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  49.04 
 
 		 318 aa  315  7e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  44.16 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  45.25 
 
 		 314 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  47.19 
 
 		 324 aa  285  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  45.63 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1123  hypothetical protein  45.31 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  44.44 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  45.31 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  45.31 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0963  hypothetical protein  44.98 
 
 		 318 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  45.81 
 
 		 326 aa  271  9e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  45.63 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  44.98 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  45.65 
 
 		 370 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  45.95 
 
 		 316 aa  265  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  44.27 
 
 		 326 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1208  hypothetical protein  44.52 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.569232  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  43.55 
 
 		 318 aa  262  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  43.71 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  44.09 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  46.93 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  43.13 
 
 		 323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  47.3 
 
 		 318 aa  258  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  44.16 
 
 		 323 aa  256  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3010  hypothetical protein  43.27 
 
 		 315 aa  255  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  44.05 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  44.05 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  44.09 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  43.26 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  43.91 
 
 		 316 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  43.73 
 
 		 319 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  43.73 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.728517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  41.77 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  42.94 
 
 		 335 aa  248  7e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  42.12 
 
 		 316 aa  248  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  43.13 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  44.41 
 
 		 316 aa  245  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  41.4 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  43.49 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  40.45 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41400  hypothetical protein  42.41 
 
 		 317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.476626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4334  protein of unknown function DUF523  38.84 
 
 		 327 aa  215  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.928853  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0722  hypothetical protein  60.38 
 
 		 169 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.302586  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  36.86 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  36.76 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2929  Protein of unknown function DUF1722  59.75 
 
 		 169 aa  202  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0624  hypothetical protein  59.75 
 
 		 169 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0754  hypothetical protein  59.75 
 
 		 169 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0760675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1610  protein of unknown function DUF1722  37.86 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00667  hypothetical protein  58.49 
 
 		 169 aa  198  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2948  hypothetical protein  58.49 
 
 		 169 aa  198  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0572605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0732  hypothetical protein  58.49 
 
 		 169 aa  198  9e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00656  hypothetical protein  58.49 
 
 		 169 aa  198  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0797  hypothetical protein  58.49 
 
 		 169 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  34.74 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4454  protein of unknown function DUF523  35.87 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  35.41 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1150  protein of unknown function DUF523  35.87 
 
 		 315 aa  189  8e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.441382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  34.94 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0380  hypothetical protein  32.57 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0412  Protein of unknown function DUF1722  32.58 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000671457  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1500  hypothetical protein  34.42 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  33.22 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  32.9 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  32.9 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04980  hypothetical protein  32.9 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1601  hypothetical protein  30.94 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0115069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  32.9 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  32.57 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>