181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1953 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  100 
 
 		 319 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  99.06 
 
 		 319 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  98.12 
 
 		 319 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  99.06 
 
 		 319 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  98.75 
 
 		 319 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  79.31 
 
 		 319 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  79.31 
 
 		 319 aa  540  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  75.55 
 
 		 319 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  68.03 
 
 		 319 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  60.52 
 
 		 319 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  59.49 
 
 		 317 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  59.55 
 
 		 319 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  58.58 
 
 		 319 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  58.1 
 
 		 317 aa  381  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  50.78 
 
 		 322 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  48.23 
 
 		 317 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  47.59 
 
 		 317 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  46.95 
 
 		 317 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  46.95 
 
 		 317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1163  hypothetical protein  47.27 
 
 		 317 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  46.62 
 
 		 317 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  46.62 
 
 		 317 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0865  hypothetical protein  47.77 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3386  hypothetical protein  47.91 
 
 		 317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  46.3 
 
 		 317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1164  hypothetical protein  46.62 
 
 		 317 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  48.44 
 
 		 316 aa  299  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  47.81 
 
 		 316 aa  295  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  46.67 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  46.67 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  46.01 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3039  hypothetical protein  44.13 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  44.94 
 
 		 318 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  44.06 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  42.9 
 
 		 322 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  43.17 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  43.35 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  44.2 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  43.37 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  41.51 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  44.16 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1208  hypothetical protein  43.75 
 
 		 326 aa  262  6.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.569232  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  46.35 
 
 		 319 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  46.54 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0963  hypothetical protein  40.44 
 
 		 318 aa  255  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1123  hypothetical protein  40.75 
 
 		 318 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  40.69 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3010  hypothetical protein  40.65 
 
 		 315 aa  249  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  42.44 
 
 		 318 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  41.87 
 
 		 324 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  41.8 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  42.12 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  40.44 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  43.08 
 
 		 335 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  42.86 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  42.21 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  38.26 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  42.22 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  41.35 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.728517 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  40.31 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  40.32 
 
 		 323 aa  233  5e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  41.4 
 
 		 315 aa  232  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  41.51 
 
 		 370 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  41.53 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41400  hypothetical protein  42.77 
 
 		 317 aa  225  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.476626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  39.44 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  40.13 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  41.07 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  39.44 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  40 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1610  protein of unknown function DUF1722  40.31 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  35.53 
 
 		 332 aa  209  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  38.05 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4334  protein of unknown function DUF523  41.14 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.928853  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  35.76 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4454  protein of unknown function DUF523  36.71 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  34.73 
 
 		 322 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1500  hypothetical protein  35.37 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  33.12 
 
 		 322 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  32.36 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  34.75 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  32.8 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  34.08 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  32.15 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2547  hypothetical protein  31.83 
 
 		 322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194439  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0716  Protein of unknown function DUF1722  32.8 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000994738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  31.19 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  31.83 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  31.19 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  31.19 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  31.19 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1601  hypothetical protein  30.97 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0115069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04980  hypothetical protein  32.27 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  31.43 
 
 		 316 aa  175  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0380  hypothetical protein  31.29 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0311  hypothetical protein  30.65 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0722  hypothetical protein  48.17 
 
 		 169 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.302586  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0536  hypothetical protein  29.68 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.037048  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2929  Protein of unknown function DUF1722  49.68 
 
 		 169 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0624  hypothetical protein  49.68 
 
 		 169 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>