166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0395 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  760    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  69.78 
 
 
324 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  70.86 
 
 
335 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  61.76 
 
 
316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  58.44 
 
 
314 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  58.9 
 
 
323 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  58.57 
 
 
315 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  58.13 
 
 
316 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  56.88 
 
 
323 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  57.23 
 
 
316 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  57.68 
 
 
316 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  56.25 
 
 
315 aa  352  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  54.37 
 
 
316 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  57.99 
 
 
316 aa  348  7e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  54.66 
 
 
318 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.728517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  53.44 
 
 
319 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  53.09 
 
 
318 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  53.09 
 
 
318 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  52.02 
 
 
311 aa  325  8.000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  47.98 
 
 
332 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  48.75 
 
 
319 aa  308  9e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  48.77 
 
 
316 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1208  hypothetical protein  49.69 
 
 
326 aa  294  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.569232  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  44.92 
 
 
320 aa  285  9e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  46.73 
 
 
320 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  47.53 
 
 
322 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  46.11 
 
 
322 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  44.97 
 
 
322 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  44.55 
 
 
317 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  46.11 
 
 
322 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  45.6 
 
 
316 aa  279  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3386  hypothetical protein  44.65 
 
 
317 aa  278  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3039  hypothetical protein  43.29 
 
 
320 aa  278  9e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  44.97 
 
 
317 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0963  hypothetical protein  44.86 
 
 
318 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  42.86 
 
 
318 aa  277  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1163  hypothetical protein  44.65 
 
 
317 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  44.34 
 
 
317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  44.55 
 
 
317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  44.34 
 
 
317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  44.65 
 
 
316 aa  273  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1164  hypothetical protein  44.34 
 
 
317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  44.03 
 
 
317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1123  hypothetical protein  44.55 
 
 
318 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  46.44 
 
 
322 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  46.15 
 
 
319 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  46.37 
 
 
318 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  45.65 
 
 
319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0865  hypothetical protein  41.82 
 
 
314 aa  269  7e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  45.31 
 
 
319 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1610  protein of unknown function DUF1722  44.41 
 
 
321 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  42.55 
 
 
318 aa  257  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  43.75 
 
 
317 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  46.25 
 
 
319 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  45.65 
 
 
317 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  42.94 
 
 
326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  43.26 
 
 
317 aa  253  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  41.93 
 
 
324 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  40.37 
 
 
326 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3010  hypothetical protein  41.74 
 
 
315 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  40.57 
 
 
319 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4454  protein of unknown function DUF523  42.45 
 
 
332 aa  245  9e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41400  hypothetical protein  44.89 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.476626  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  40.62 
 
 
314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  42.45 
 
 
319 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  37.7 
 
 
315 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  41.88 
 
 
319 aa  232  9e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  38.92 
 
 
332 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  41.51 
 
 
319 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  41.19 
 
 
319 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  41.19 
 
 
319 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  41.19 
 
 
319 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  40.25 
 
 
314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  40.88 
 
 
319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  40.57 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  42.45 
 
 
319 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4334  protein of unknown function DUF523  40.5 
 
 
327 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.928853  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1150  protein of unknown function DUF523  36.79 
 
 
315 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.441382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  35.67 
 
 
316 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  35.14 
 
 
339 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0852  hypothetical protein  56.9 
 
 
186 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0139574  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1500  hypothetical protein  34.95 
 
 
333 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244605  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2274  hypothetical protein  37.78 
 
 
334 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0716  Protein of unknown function DUF1722  32.91 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000994738  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1381  protein of unknown function DUF523  37.5 
 
 
312 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04980  hypothetical protein  33.86 
 
 
324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  32.69 
 
 
322 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  33.87 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  32.69 
 
 
322 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2547  hypothetical protein  32.37 
 
 
322 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  32.69 
 
 
322 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  32.69 
 
 
322 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  32.69 
 
 
322 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  32.36 
 
 
322 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  32.69 
 
 
322 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  32.69 
 
 
322 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  32.69 
 
 
327 aa  173  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0412  Protein of unknown function DUF1722  27.99 
 
 
308 aa  170  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000671457  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0380  hypothetical protein  29.39 
 
 
322 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1601  hypothetical protein  30 
 
 
322 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0115069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>