189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1478 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  75.48 
 
 		 314 aa  494  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  58.47 
 
 		 319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  51.92 
 
 		 318 aa  347  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  50.64 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  51.44 
 
 		 320 aa  339  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  50.32 
 
 		 317 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  53.05 
 
 		 317 aa  338  8e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  50.32 
 
 		 317 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  50 
 
 		 317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  49.68 
 
 		 317 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  50 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1164  hypothetical protein  50 
 
 		 317 aa  333  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3386  hypothetical protein  49.04 
 
 		 317 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1163  hypothetical protein  49.68 
 
 		 317 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3039  hypothetical protein  49.84 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  50.16 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  51.12 
 
 		 322 aa  319  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  49.53 
 
 		 319 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  49.84 
 
 		 319 aa  311  7.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  48.41 
 
 		 319 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  47 
 
 		 317 aa  309  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1208  hypothetical protein  46.62 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.569232  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  45.94 
 
 		 319 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  48.58 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  47.44 
 
 		 322 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  47.44 
 
 		 322 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  49.36 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  46.67 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  46.35 
 
 		 319 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  46.35 
 
 		 319 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  46.35 
 
 		 319 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  46.35 
 
 		 319 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  46.35 
 
 		 319 aa  288  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  46.52 
 
 		 319 aa  288  9e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  47.63 
 
 		 316 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0865  hypothetical protein  46.01 
 
 		 314 aa  287  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  46.65 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  46.98 
 
 		 320 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  46.79 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  45.66 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0963  hypothetical protein  44.73 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1123  hypothetical protein  45.11 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  47.88 
 
 		 318 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  47.48 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  44.59 
 
 		 315 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  44.23 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  47.23 
 
 		 319 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  43.69 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  43.77 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  43.57 
 
 		 318 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3010  hypothetical protein  41.75 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  43.12 
 
 		 335 aa  258  7e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  41.35 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  42.32 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  44.79 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  43.73 
 
 		 316 aa  255  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41400  hypothetical protein  46.62 
 
 		 317 aa  252  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.476626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  43.81 
 
 		 316 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  41.53 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.728517 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  40.78 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  40.19 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  40.62 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  42.99 
 
 		 316 aa  241  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  39.87 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  40.45 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  41.53 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  40.89 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  39.42 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  40.06 
 
 		 319 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  38.02 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  39.03 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4454  protein of unknown function DUF523  39.24 
 
 		 332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  36.94 
 
 		 332 aa  209  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1610  protein of unknown function DUF1722  37.34 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  35.62 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4334  protein of unknown function DUF523  36.89 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.928853  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  37.62 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1150  protein of unknown function DUF523  34.71 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.441382  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0716  Protein of unknown function DUF1722  33.22 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000994738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  33.44 
 
 		 339 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  33.88 
 
 		 322 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  32.57 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  32.57 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2547  hypothetical protein  32.24 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  31.92 
 
 		 322 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  32.25 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  32.25 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  31.91 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  31.91 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  31.91 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0380  hypothetical protein  29.41 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04980  hypothetical protein  30.13 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2274  hypothetical protein  31.8 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1381  protein of unknown function DUF523  32.68 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  31.05 
 
 		 327 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0412  Protein of unknown function DUF1722  30.72 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000671457  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1297  hypothetical protein  32.12 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1601  hypothetical protein  28.43 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0115069  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0536  hypothetical protein  27.45 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.037048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>