214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1251 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  77.39 
 
 
319 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  76.75 
 
 
319 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  72.47 
 
 
317 aa  481  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  72.29 
 
 
319 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  59.68 
 
 
319 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  58.1 
 
 
319 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  58.1 
 
 
319 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  58.1 
 
 
319 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  58.1 
 
 
319 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  58.1 
 
 
319 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  58.73 
 
 
319 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  56.19 
 
 
319 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  56.83 
 
 
319 aa  358  8e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  53.94 
 
 
322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0865  hypothetical protein  52.87 
 
 
314 aa  348  7e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  52.83 
 
 
316 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  50.94 
 
 
316 aa  328  7e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  51.11 
 
 
317 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  49.04 
 
 
317 aa  325  7e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1163  hypothetical protein  48.73 
 
 
317 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1164  hypothetical protein  49.04 
 
 
317 aa  323  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  48.41 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  48.73 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  48.41 
 
 
317 aa  319  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  49.84 
 
 
320 aa  319  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  48.41 
 
 
317 aa  319  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  48.73 
 
 
317 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3386  hypothetical protein  48.41 
 
 
317 aa  318  6e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  47 
 
 
314 aa  309  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3039  hypothetical protein  46.37 
 
 
320 aa  308  9e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  47.3 
 
 
318 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  45.08 
 
 
319 aa  291  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  46.06 
 
 
314 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  46.2 
 
 
332 aa  287  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  45.68 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  43.18 
 
 
322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1123  hypothetical protein  43.91 
 
 
318 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  45.37 
 
 
316 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0963  hypothetical protein  43.59 
 
 
318 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  42.68 
 
 
326 aa  268  8e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  42.21 
 
 
322 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  45.45 
 
 
319 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1208  hypothetical protein  44.19 
 
 
326 aa  263  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.569232  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  42.21 
 
 
322 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  42.53 
 
 
322 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  45.45 
 
 
318 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  42.41 
 
 
316 aa  260  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  41.4 
 
 
320 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  42.26 
 
 
318 aa  259  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  45.66 
 
 
326 aa  259  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  43.75 
 
 
370 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  43.49 
 
 
316 aa  256  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  41.96 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  43.13 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  43.13 
 
 
318 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3010  hypothetical protein  41.35 
 
 
315 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  42.31 
 
 
323 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  42.09 
 
 
316 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  43.12 
 
 
315 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  43.22 
 
 
316 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  42.17 
 
 
318 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  41.85 
 
 
318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.728517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  40.76 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  41.59 
 
 
323 aa  243  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  43.17 
 
 
319 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  41.16 
 
 
335 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  43.71 
 
 
316 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  41.14 
 
 
311 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  41.82 
 
 
316 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  40.19 
 
 
315 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1610  protein of unknown function DUF1722  41.88 
 
 
321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41400  hypothetical protein  41.59 
 
 
317 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.476626  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  37.81 
 
 
332 aa  210  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4334  protein of unknown function DUF523  39.03 
 
 
327 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.928853  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  35.41 
 
 
315 aa  203  4e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0722  hypothetical protein  56.63 
 
 
169 aa  199  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.302586  normal  0.600438 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2929  Protein of unknown function DUF1722  57.49 
 
 
169 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0754  hypothetical protein  57.49 
 
 
169 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0760675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0624  hypothetical protein  57.49 
 
 
169 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00667  hypothetical protein  57.49 
 
 
169 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00656  hypothetical protein  57.49 
 
 
169 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0732  hypothetical protein  57.49 
 
 
169 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2948  hypothetical protein  57.49 
 
 
169 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0572605  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0797  hypothetical protein  57.49 
 
 
169 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  34.31 
 
 
339 aa  192  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4454  protein of unknown function DUF523  35.81 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1381  protein of unknown function DUF523  38.11 
 
 
312 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1150  protein of unknown function DUF523  33.65 
 
 
315 aa  186  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.441382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  32.25 
 
 
316 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  33.01 
 
 
322 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  32.04 
 
 
322 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  32.04 
 
 
322 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  32.04 
 
 
322 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  32.15 
 
 
322 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  31.72 
 
 
322 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2547  hypothetical protein  31.72 
 
 
322 aa  175  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  31.72 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  31.72 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3585  hypothetical protein  63.01 
 
 
160 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>