175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2839 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3386  hypothetical protein  78.66 
 
 
317 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  78.98 
 
 
317 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  78.66 
 
 
317 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  78.66 
 
 
317 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  78.66 
 
 
317 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  78.98 
 
 
317 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  78.03 
 
 
317 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1164  hypothetical protein  78.03 
 
 
317 aa  531  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1163  hypothetical protein  77.71 
 
 
317 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3039  hypothetical protein  79.3 
 
 
320 aa  528  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  65.92 
 
 
317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  58.41 
 
 
318 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  51.44 
 
 
314 aa  339  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  50.97 
 
 
319 aa  333  3e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  51.23 
 
 
322 aa  328  8e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  50.16 
 
 
319 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  51.76 
 
 
314 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  49.53 
 
 
319 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  50.32 
 
 
319 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  49.84 
 
 
317 aa  319  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  47.92 
 
 
322 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  49.36 
 
 
316 aa  308  9e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1123  hypothetical protein  47.6 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  47.32 
 
 
322 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  49.52 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  48.06 
 
 
320 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  46.56 
 
 
322 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0963  hypothetical protein  46.65 
 
 
318 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  46.56 
 
 
322 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  48.9 
 
 
317 aa  299  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  47.17 
 
 
332 aa  296  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  48.41 
 
 
319 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0865  hypothetical protein  47.28 
 
 
314 aa  293  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  48.88 
 
 
316 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  47.59 
 
 
319 aa  292  5e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  46.67 
 
 
319 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  46.67 
 
 
319 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  46.67 
 
 
319 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  46.67 
 
 
319 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  46.67 
 
 
319 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  46.15 
 
 
319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  47.9 
 
 
318 aa  288  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3010  hypothetical protein  47.44 
 
 
315 aa  286  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  44.92 
 
 
370 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  45.19 
 
 
318 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  45.14 
 
 
324 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  47.28 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  48.56 
 
 
319 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  44.55 
 
 
318 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  45.16 
 
 
326 aa  278  6e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1208  hypothetical protein  45.31 
 
 
326 aa  277  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.569232  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  44.09 
 
 
315 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  42.46 
 
 
335 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  45.63 
 
 
319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  44.95 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  44.76 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  42.77 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.728517 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  45.34 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  45.11 
 
 
316 aa  271  9e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  41.8 
 
 
323 aa  269  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  44.55 
 
 
314 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41400  hypothetical protein  43.91 
 
 
317 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.476626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  43.51 
 
 
311 aa  261  8e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  44.34 
 
 
316 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  43.45 
 
 
315 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  44.23 
 
 
324 aa  260  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  43.87 
 
 
316 aa  258  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  42.77 
 
 
319 aa  258  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  40.65 
 
 
326 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  41.74 
 
 
323 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  44.19 
 
 
316 aa  248  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4334  protein of unknown function DUF523  38.99 
 
 
327 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.928853  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4454  protein of unknown function DUF523  39.33 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  36.31 
 
 
332 aa  217  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1610  protein of unknown function DUF1722  35.2 
 
 
321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  37.79 
 
 
315 aa  211  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  36.96 
 
 
339 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  36.45 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1381  protein of unknown function DUF523  33.86 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0716  Protein of unknown function DUF1722  32.7 
 
 
311 aa  182  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000994738  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1150  protein of unknown function DUF523  33.44 
 
 
315 aa  178  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.441382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1500  hypothetical protein  33.65 
 
 
333 aa  175  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244605  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  34.41 
 
 
322 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0412  Protein of unknown function DUF1722  32.9 
 
 
308 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000671457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04980  hypothetical protein  32.26 
 
 
324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  32.59 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  32.27 
 
 
322 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  32.27 
 
 
322 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  31.63 
 
 
322 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2547  hypothetical protein  30.77 
 
 
322 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  31.95 
 
 
322 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  31.95 
 
 
322 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  31.95 
 
 
322 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  31.95 
 
 
322 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1601  hypothetical protein  31.27 
 
 
322 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0115069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  30.29 
 
 
327 aa  153  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2274  hypothetical protein  31.68 
 
 
334 aa  153  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0536  hypothetical protein  29.41 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.037048  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0380  hypothetical protein  29.13 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>