185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3230 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  100 
 
 		 316 aa  651    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  96.2 
 
 		 316 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  73.48 
 
 		 323 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  72.29 
 
 		 316 aa  474  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  70.57 
 
 		 315 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  58.65 
 
 		 314 aa  388  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  58.01 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  57.59 
 
 		 324 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  56.33 
 
 		 316 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  57.99 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  58.97 
 
 		 316 aa  362  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  54.84 
 
 		 315 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  55.83 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  52.87 
 
 		 316 aa  338  8e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  51.13 
 
 		 319 aa  318  7e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  51.44 
 
 		 311 aa  311  7.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  50.31 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  49.52 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.728517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  49.84 
 
 		 319 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  49.69 
 
 		 318 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1208  hypothetical protein  49.36 
 
 		 326 aa  292  6e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.569232  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  47.59 
 
 		 332 aa  288  7e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  47.1 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  46.5 
 
 		 320 aa  275  9e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1164  hypothetical protein  44.84 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3386  hypothetical protein  45.48 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1163  hypothetical protein  44.52 
 
 		 317 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  44.52 
 
 		 317 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  44.52 
 
 		 318 aa  269  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0865  hypothetical protein  41.94 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  45.51 
 
 		 322 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1123  hypothetical protein  43.55 
 
 		 318 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3039  hypothetical protein  45.16 
 
 		 320 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0963  hypothetical protein  42.9 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  44.87 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  44.19 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  44.19 
 
 		 317 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  44.19 
 
 		 317 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  44.87 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  44.19 
 
 		 317 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  43.45 
 
 		 322 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  44.19 
 
 		 317 aa  261  8e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  45.11 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  43.23 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  44.59 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  42.63 
 
 		 318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  44.76 
 
 		 319 aa  258  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  43.87 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  42.99 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  44.55 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  43.13 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  45.37 
 
 		 326 aa  255  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  43.49 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  39.87 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4454  protein of unknown function DUF523  44.44 
 
 		 332 aa  252  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  44.97 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0852  hypothetical protein  69.54 
 
 		 186 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0139574  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3010  hypothetical protein  42.72 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  41.82 
 
 		 317 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  39.67 
 
 		 315 aa  249  6e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  44.09 
 
 		 319 aa  248  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  44.27 
 
 		 314 aa  247  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1610  protein of unknown function DUF1722  40.65 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  43.26 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  42.9 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  42.9 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  41.48 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  41.69 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  41.07 
 
 		 319 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  41.07 
 
 		 319 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  41.07 
 
 		 319 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  41.07 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  41.07 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  41.43 
 
 		 319 aa  228  9e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  42.81 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  38.73 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41400  hypothetical protein  43.17 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.476626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4334  protein of unknown function DUF523  39.35 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.928853  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1150  protein of unknown function DUF523  36.98 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.441382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04980  hypothetical protein  35.46 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  34.74 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0716  Protein of unknown function DUF1722  32.47 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000994738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  36.66 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  35.69 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  35.69 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  35.69 
 
 		 322 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  35.69 
 
 		 322 aa  185  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  35.69 
 
 		 322 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  35.69 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  35.37 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2547  hypothetical protein  34.73 
 
 		 322 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194439  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1381  protein of unknown function DUF523  35.95 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  34.73 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  33.65 
 
 		 327 aa  179  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2274  hypothetical protein  35.92 
 
 		 334 aa  178  9e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  33.87 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0380  hypothetical protein  30.49 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1601  hypothetical protein  28.38 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0115069  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0412  Protein of unknown function DUF1722  29.37 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000671457  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0536  hypothetical protein  28.05 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.037048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>