170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2713 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  669    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0963  hypothetical protein  47.92 
 
 		 318 aa  315  8e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  48.89 
 
 		 326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1123  hypothetical protein  47.28 
 
 		 318 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  48.06 
 
 		 320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  48.89 
 
 		 316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  46.82 
 
 		 319 aa  302  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1208  hypothetical protein  46.84 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.569232  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  45.74 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  46.01 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  44.97 
 
 		 322 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  45 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  46.01 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41400  hypothetical protein  47.27 
 
 		 317 aa  281  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.476626  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  46.54 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  44.55 
 
 		 318 aa  277  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  41.85 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3010  hypothetical protein  44.41 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  44.48 
 
 		 319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  44.16 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  43.91 
 
 		 314 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1163  hypothetical protein  45.05 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  45.05 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  44.84 
 
 		 319 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  45.05 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0865  hypothetical protein  42.44 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  45.16 
 
 		 318 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3039  hypothetical protein  43.59 
 
 		 320 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3386  hypothetical protein  44.73 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  44.73 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  44.73 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  44.73 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  45.08 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1164  hypothetical protein  44.73 
 
 		 317 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  44.23 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  41.35 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  42.68 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  42.22 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.728517 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  42.36 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  42.81 
 
 		 316 aa  255  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  40.95 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  41.96 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  41.9 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  42.09 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  41.93 
 
 		 370 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  42.63 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  41.4 
 
 		 323 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  39.5 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  42.9 
 
 		 317 aa  248  8e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  38.41 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  41.72 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  41.72 
 
 		 318 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  41.08 
 
 		 316 aa  246  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  38.87 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  41.4 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  43.13 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  39.51 
 
 		 324 aa  242  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  40.76 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  40.71 
 
 		 319 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  40.51 
 
 		 319 aa  235  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  39.56 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  40.31 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  39.43 
 
 		 316 aa  232  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  40.31 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  40.31 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  40.31 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  40.31 
 
 		 319 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  39.51 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  39.94 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1610  protein of unknown function DUF1722  39.68 
 
 		 321 aa  225  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4334  protein of unknown function DUF523  42.44 
 
 		 327 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.928853  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  37.78 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  39.3 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  39.14 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  36.16 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  38.51 
 
 		 319 aa  209  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1150  protein of unknown function DUF523  36.94 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.441382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4454  protein of unknown function DUF523  37.38 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0412  Protein of unknown function DUF1722  31.58 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000671457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  31.58 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0716  Protein of unknown function DUF1722  28.85 
 
 		 311 aa  164  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000994738  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1601  hypothetical protein  28.9 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0115069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04980  hypothetical protein  29.11 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0536  hypothetical protein  27.48 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.037048  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0311  hypothetical protein  28.12 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  30.84 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1500  hypothetical protein  31.27 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  26.89 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0380  hypothetical protein  25.57 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  28.52 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0852  hypothetical protein  47.62 
 
 		 186 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0139574  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1297  hypothetical protein  29.35 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1381  protein of unknown function DUF523  31.6 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  28.57 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  27.92 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  28.25 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  27.92 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  27.92 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  27.92 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  27.92 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>