209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1612 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  647    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1150  protein of unknown function DUF523  52.38 
 
 
315 aa  332  7.000000000000001e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.441382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  42.9 
 
 
316 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  41.35 
 
 
323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  40.26 
 
 
316 aa  258  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  40.32 
 
 
316 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  39.5 
 
 
332 aa  252  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  40.06 
 
 
315 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  40.65 
 
 
316 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  38.26 
 
 
323 aa  249  4e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  37.5 
 
 
315 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3010  hypothetical protein  40.06 
 
 
315 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  38.98 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  38.78 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  40 
 
 
316 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  36.66 
 
 
319 aa  242  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  37.81 
 
 
370 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  36.66 
 
 
319 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  38.75 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  40.06 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  35.69 
 
 
318 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  36.42 
 
 
335 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  35.9 
 
 
318 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  38.85 
 
 
324 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  35.99 
 
 
318 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.728517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1610  protein of unknown function DUF1722  35.69 
 
 
321 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  37.74 
 
 
316 aa  225  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0963  hypothetical protein  36.1 
 
 
318 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4454  protein of unknown function DUF523  37.62 
 
 
332 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  39.62 
 
 
316 aa  222  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0865  hypothetical protein  36.42 
 
 
314 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1123  hypothetical protein  36.1 
 
 
318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  38.22 
 
 
319 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  38.29 
 
 
322 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  38.29 
 
 
322 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  34.41 
 
 
332 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  36.94 
 
 
322 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  37.97 
 
 
322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3386  hypothetical protein  38.26 
 
 
317 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  38.26 
 
 
320 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1163  hypothetical protein  37.5 
 
 
317 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  37.5 
 
 
317 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  35.9 
 
 
316 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  36.62 
 
 
318 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  38.34 
 
 
316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  37.1 
 
 
317 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  37.1 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  37.1 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  37.1 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  37.1 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1164  hypothetical protein  37.18 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  36.13 
 
 
319 aa  211  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  37.06 
 
 
318 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  37.1 
 
 
317 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  36.13 
 
 
314 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1208  hypothetical protein  37.58 
 
 
326 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.569232  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  34.08 
 
 
326 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  34.29 
 
 
318 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  35.67 
 
 
319 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3039  hypothetical protein  35.81 
 
 
320 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  35.58 
 
 
317 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  35.67 
 
 
319 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  35.14 
 
 
320 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  38.06 
 
 
314 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  36.01 
 
 
326 aa  206  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  36.94 
 
 
319 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  36.31 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  39.23 
 
 
319 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  35.5 
 
 
339 aa  198  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  35.14 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41400  hypothetical protein  35.78 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.476626  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  34.39 
 
 
319 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  33.97 
 
 
317 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  34.71 
 
 
319 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  34.71 
 
 
319 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  34.71 
 
 
319 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  34.71 
 
 
319 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  34.71 
 
 
319 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0716  Protein of unknown function DUF1722  34.85 
 
 
311 aa  191  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000994738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4334  protein of unknown function DUF523  33.01 
 
 
327 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.928853  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04980  hypothetical protein  35.48 
 
 
324 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  35.6 
 
 
316 aa  185  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1601  hypothetical protein  33.01 
 
 
322 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0115069  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0536  hypothetical protein  32.69 
 
 
322 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.037048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  33.55 
 
 
322 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0311  hypothetical protein  32.05 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0380  hypothetical protein  33.65 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1381  protein of unknown function DUF523  31.8 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2547  hypothetical protein  32.9 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  33.22 
 
 
322 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  33.22 
 
 
322 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  33.22 
 
 
322 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  32.14 
 
 
327 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  33.22 
 
 
322 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  33.22 
 
 
322 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  32.57 
 
 
322 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  32.9 
 
 
322 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  32.9 
 
 
322 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1297  hypothetical protein  34.75 
 
 
307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0412  Protein of unknown function DUF1722  32.04 
 
 
308 aa  160  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000671457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>