170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1208 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1208  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  664    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.569232  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  56.04 
 
 
326 aa  354  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  55.91 
 
 
332 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  54.55 
 
 
322 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  54.55 
 
 
322 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  52.06 
 
 
320 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  53.61 
 
 
322 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1123  hypothetical protein  51.88 
 
 
318 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0963  hypothetical protein  51.88 
 
 
318 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  53.33 
 
 
322 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  53.18 
 
 
316 aa  322  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41400  hypothetical protein  54.52 
 
 
317 aa  308  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.476626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  50.95 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  46.84 
 
 
324 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  51.61 
 
 
318 aa  298  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  46.6 
 
 
318 aa  298  9e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  46.62 
 
 
314 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  49.68 
 
 
319 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  51.29 
 
 
319 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  49.69 
 
 
370 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  49.37 
 
 
323 aa  294  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  49.84 
 
 
316 aa  292  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3386  hypothetical protein  46.6 
 
 
317 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  48.09 
 
 
311 aa  289  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  47.45 
 
 
323 aa  287  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  48.4 
 
 
316 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1163  hypothetical protein  46.6 
 
 
317 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  46.6 
 
 
317 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  46.93 
 
 
317 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  46.93 
 
 
317 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  46.93 
 
 
317 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  46.93 
 
 
317 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  46.28 
 
 
317 aa  285  9e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  47.15 
 
 
318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.728517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1164  hypothetical protein  46.28 
 
 
317 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  46.35 
 
 
315 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  44.06 
 
 
318 aa  280  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  46.93 
 
 
317 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  48.88 
 
 
319 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  45.31 
 
 
320 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  49.36 
 
 
316 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  47.52 
 
 
324 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  44.55 
 
 
322 aa  275  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  45.86 
 
 
314 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  47.12 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  45.51 
 
 
316 aa  272  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  47.47 
 
 
315 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  48.24 
 
 
318 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  42.36 
 
 
319 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  47.92 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  46.01 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  47.1 
 
 
317 aa  268  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  44.87 
 
 
316 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  44.52 
 
 
319 aa  263  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  43.37 
 
 
314 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  39.94 
 
 
326 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  44.19 
 
 
317 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3039  hypothetical protein  42.5 
 
 
320 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  43.75 
 
 
319 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3010  hypothetical protein  43.13 
 
 
315 aa  262  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  45.83 
 
 
316 aa  259  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  43.44 
 
 
319 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  43.44 
 
 
319 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  43.44 
 
 
319 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  43.44 
 
 
319 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  44.19 
 
 
319 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  44.52 
 
 
319 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0865  hypothetical protein  40.65 
 
 
314 aa  255  9e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  43.04 
 
 
319 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  42.31 
 
 
319 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  41.96 
 
 
319 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1610  protein of unknown function DUF1722  42.22 
 
 
321 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4334  protein of unknown function DUF523  43.17 
 
 
327 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.928853  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  42.21 
 
 
319 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4454  protein of unknown function DUF523  40.5 
 
 
332 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  38.03 
 
 
315 aa  207  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  37.58 
 
 
332 aa  202  9e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1150  protein of unknown function DUF523  37.74 
 
 
315 aa  194  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.441382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  34.18 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  32.13 
 
 
339 aa  179  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  31.99 
 
 
322 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  31.68 
 
 
322 aa  165  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0852  hypothetical protein  51.79 
 
 
186 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0139574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2547  hypothetical protein  31.17 
 
 
322 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  30.99 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0412  Protein of unknown function DUF1722  28.62 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000671457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  31.68 
 
 
322 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  31.37 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  31.37 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  31.37 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1381  protein of unknown function DUF523  38.13 
 
 
312 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  31.45 
 
 
322 aa  162  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  31.68 
 
 
322 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  31.68 
 
 
322 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04980  hypothetical protein  30.49 
 
 
324 aa  158  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0716  Protein of unknown function DUF1722  29.35 
 
 
311 aa  158  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000994738  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1500  hypothetical protein  31.41 
 
 
333 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244605  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0380  hypothetical protein  27.56 
 
 
322 aa  151  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1601  hypothetical protein  27.56 
 
 
322 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0115069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1297  hypothetical protein  28.94 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>