117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00667 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00667  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  347  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00656  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  347  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0732  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  347  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2948  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  347  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0572605  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0797  hypothetical protein  98.22 
 
 
169 aa  340  7e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2929  Protein of unknown function DUF1722  97.63 
 
 
169 aa  340  8e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0754  hypothetical protein  97.63 
 
 
169 aa  340  8e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0760675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0624  hypothetical protein  97.63 
 
 
169 aa  340  8e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0722  hypothetical protein  94.67 
 
 
169 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.302586  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  61.04 
 
 
319 aa  199  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  58.49 
 
 
319 aa  198  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  57.49 
 
 
317 aa  196  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  56.49 
 
 
317 aa  186  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  55.97 
 
 
319 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  53.29 
 
 
319 aa  170  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  49.68 
 
 
319 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  50.66 
 
 
319 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  49.68 
 
 
319 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  49.68 
 
 
319 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  49.68 
 
 
319 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  49.68 
 
 
319 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  49.04 
 
 
319 aa  165  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3585  hypothetical protein  53.85 
 
 
160 aa  155  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1162  hypothetical protein  53.85 
 
 
160 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1111  hypothetical protein  53.85 
 
 
168 aa  154  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  47.37 
 
 
319 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  39.16 
 
 
322 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  40.96 
 
 
316 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  38.55 
 
 
316 aa  124  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  35.85 
 
 
317 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1163  hypothetical protein  35.85 
 
 
317 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  35.85 
 
 
317 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  34.94 
 
 
320 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1164  hypothetical protein  35.85 
 
 
317 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  35.22 
 
 
317 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  34.59 
 
 
317 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  35.22 
 
 
317 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  35.22 
 
 
317 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  35.22 
 
 
317 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3386  hypothetical protein  33.96 
 
 
317 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0865  hypothetical protein  32.69 
 
 
314 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  33.94 
 
 
324 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3039  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  34.94 
 
 
319 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  34.34 
 
 
318 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  30.72 
 
 
320 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  35.71 
 
 
314 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  31.45 
 
 
322 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  31.45 
 
 
322 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  30.72 
 
 
326 aa  99.8  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  32.69 
 
 
322 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  31.45 
 
 
322 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  34.34 
 
 
370 aa  98.6  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  31.17 
 
 
326 aa  97.8  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  32.12 
 
 
335 aa  97.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  27.22 
 
 
318 aa  96.3  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  31.52 
 
 
332 aa  95.9  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  30.91 
 
 
324 aa  95.5  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  31.52 
 
 
316 aa  94.4  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  33.73 
 
 
314 aa  94.4  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1123  hypothetical protein  29.52 
 
 
318 aa  94  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  32.7 
 
 
319 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  29.52 
 
 
316 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0963  hypothetical protein  29.52 
 
 
318 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  32.7 
 
 
318 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  31.52 
 
 
316 aa  91.7  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  33.12 
 
 
319 aa  88.6  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3010  hypothetical protein  29.03 
 
 
315 aa  88.2  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  33.11 
 
 
316 aa  87.8  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  32.68 
 
 
314 aa  87.4  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  32.91 
 
 
318 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.728517 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1208  hypothetical protein  29.45 
 
 
326 aa  85.9  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.569232  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  32.9 
 
 
316 aa  85.5  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  30.3 
 
 
316 aa  85.1  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  32.68 
 
 
318 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  32.68 
 
 
318 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  32.68 
 
 
315 aa  84.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  30.3 
 
 
319 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  30.32 
 
 
323 aa  84.7  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  32.75 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  33.58 
 
 
323 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  33.08 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41400  hypothetical protein  32.08 
 
 
317 aa  79  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.476626  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1150  protein of unknown function DUF523  27.39 
 
 
315 aa  78.2  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.441382  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  27.52 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  27.22 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1381  protein of unknown function DUF523  31.97 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  25.32 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04980  hypothetical protein  29.05 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1500  hypothetical protein  30.41 
 
 
333 aa  68.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244605  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0412  Protein of unknown function DUF1722  25.52 
 
 
308 aa  68.2  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000671457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1610  protein of unknown function DUF1722  29.09 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0974  hypothetical protein  26.92 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2274  hypothetical protein  29.75 
 
 
334 aa  65.1  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0311  hypothetical protein  26.71 
 
 
322 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  25.49 
 
 
311 aa  64.7  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4334  protein of unknown function DUF523  29.49 
 
 
327 aa  64.7  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.928853  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0380  hypothetical protein  25.64 
 
 
322 aa  64.3  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0536  hypothetical protein  24.36 
 
 
322 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.037048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1601  hypothetical protein  25.47 
 
 
322 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0115069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>