112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0974 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0974  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  354  3.9999999999999996e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  37.42 
 
 
327 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04980  hypothetical protein  35.95 
 
 
324 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1601  hypothetical protein  39.39 
 
 
322 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0115069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0311  hypothetical protein  40 
 
 
322 aa  99  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0536  hypothetical protein  39.39 
 
 
322 aa  98.6  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.037048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2547  hypothetical protein  37.11 
 
 
322 aa  94  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194439  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  36.48 
 
 
322 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0380  hypothetical protein  40.54 
 
 
322 aa  90.5  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  35.85 
 
 
322 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  35.85 
 
 
322 aa  89.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  35.85 
 
 
322 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  35.85 
 
 
322 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  35.85 
 
 
322 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  36.48 
 
 
322 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  35.85 
 
 
322 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0716  Protein of unknown function DUF1722  32.86 
 
 
311 aa  87.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000994738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  33.93 
 
 
322 aa  85.9  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  31.18 
 
 
316 aa  85.9  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2274  hypothetical protein  27.63 
 
 
334 aa  80.9  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1500  hypothetical protein  30.19 
 
 
333 aa  80.9  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244605  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  29.93 
 
 
314 aa  77  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  27.95 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  28.06 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  30.71 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  27.11 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  30.3 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1111  hypothetical protein  27.39 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  26.12 
 
 
326 aa  71.6  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3585  hypothetical protein  27.39 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1162  hypothetical protein  27.39 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  27.61 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  29.85 
 
 
322 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0412  Protein of unknown function DUF1722  33.33 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000671457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  26.53 
 
 
323 aa  68.2  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  28 
 
 
332 aa  68.2  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  25.15 
 
 
318 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.728517 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2929  Protein of unknown function DUF1722  26.92 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  24.16 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  24.54 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  24.7 
 
 
316 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1297  hypothetical protein  29.05 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0754  hypothetical protein  26.92 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0760675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0624  hypothetical protein  26.92 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  27.56 
 
 
316 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  27.11 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  26.67 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00667  hypothetical protein  26.92 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  24.54 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0732  hypothetical protein  26.92 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2948  hypothetical protein  26.92 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0572605  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  24.7 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00656  hypothetical protein  26.92 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  28.91 
 
 
317 aa  65.5  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0797  hypothetical protein  26.92 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  24.05 
 
 
335 aa  64.7  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  25.15 
 
 
320 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  23.31 
 
 
370 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0722  hypothetical protein  26.92 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.302586  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1150  protein of unknown function DUF523  26.28 
 
 
315 aa  62.8  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.441382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  28.46 
 
 
316 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  27.88 
 
 
318 aa  62  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  25 
 
 
326 aa  60.8  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  24.67 
 
 
319 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  29.14 
 
 
319 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  28.15 
 
 
319 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  27.34 
 
 
319 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  27.34 
 
 
319 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  27.34 
 
 
319 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  27.34 
 
 
319 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  27.34 
 
 
319 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  25.85 
 
 
319 aa  58.2  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  26.12 
 
 
319 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  25.98 
 
 
316 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  28.03 
 
 
319 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  26.52 
 
 
314 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  25.36 
 
 
339 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  23.96 
 
 
319 aa  55.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  27.34 
 
 
316 aa  55.5  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  26.56 
 
 
316 aa  55.1  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  54.7  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  24.63 
 
 
318 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  28.03 
 
 
320 aa  54.7  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  24.14 
 
 
318 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  24.14 
 
 
318 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  24.71 
 
 
319 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  26.23 
 
 
322 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  24.1 
 
 
314 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  26.23 
 
 
322 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  28.79 
 
 
317 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  28.79 
 
 
317 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  27.33 
 
 
317 aa  52.4  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  28.79 
 
 
317 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  28.79 
 
 
317 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  24.18 
 
 
332 aa  52.4  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  23.81 
 
 
324 aa  52  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  24.19 
 
 
318 aa  52  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  25.41 
 
 
322 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  23.62 
 
 
322 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  29.32 
 
 
317 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>