54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1549 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  100 
 
 
418 aa  856    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  45.86 
 
 
420 aa  326  4.0000000000000003e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.295167 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2043  putative UV damage endonuclease  33.95 
 
 
412 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2329  putative UV damage endonuclease  36.88 
 
 
412 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.385133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1722  putative UV damage endonuclease  32.65 
 
 
301 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1671  putative UV damage endonuclease  37.41 
 
 
321 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00771336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09690  UV-damage endonuclease  31.31 
 
 
309 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  30.46 
 
 
321 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5482  putative UV damage endonuclease  29.29 
 
 
317 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00076695  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5525  putative UV damage endonuclease  29.29 
 
 
325 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5470  putative UV damage endonuclease  29.59 
 
 
317 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000392021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5031  putative UV damage endonuclease  28.96 
 
 
317 aa  156  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5196  putative UV damage endonuclease  28.96 
 
 
325 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5478  putative UV damage endonuclease  29.17 
 
 
317 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5440  putative UV damage endonuclease  28.96 
 
 
325 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5047  putative UV damage endonuclease  28.96 
 
 
325 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.43469  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2026  UV-endonuclease UvdE  35.84 
 
 
311 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5592  putative UV damage endonuclease  28.62 
 
 
325 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5145  putative UV damage endonuclease  28.3 
 
 
317 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03600  conserved hypothetical protein  35.42 
 
 
612 aa  149  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.574638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0352  putative UV damage endonuclease  30.98 
 
 
320 aa  146  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0226  putative UV damage endonuclease  29.43 
 
 
320 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0282  putative UV damage endonuclease  29.43 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0268  putative UV damage endonuclease  28.86 
 
 
320 aa  140  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0261  putative UV damage endonuclease  28.86 
 
 
320 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5061  putative UV damage endonuclease  29.43 
 
 
320 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0220  putative UV damage endonuclease  28.86 
 
 
320 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0263  putative UV damage endonuclease  29.43 
 
 
320 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1346  putative UV damage endonuclease  30.87 
 
 
306 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0248  putative UV damage endonuclease  28.86 
 
 
320 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0222  putative UV damage endonuclease  29.1 
 
 
320 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0234  putative UV damage endonuclease  28.86 
 
 
320 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00604  endonuclease (Eurofung)  31.52 
 
 
591 aa  133  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2424  UV-endonuclease UvdE  30.74 
 
 
353 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4123  putative UV damage endonuclease  37.43 
 
 
308 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0174  putative UV damage endonuclease  29.53 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0136  putative UV damage endonuclease  33.65 
 
 
225 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0573  putative UV damage endonuclease  30.74 
 
 
315 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280192  normal  0.431721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3025  putative UV damage endonuclease  30.45 
 
 
298 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2305  UV-endonuclease UvdE  26.01 
 
 
297 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1819  putative UV damage endonuclease  31.34 
 
 
311 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.594158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0383  UV damage repair endonuclease-like protein  30.53 
 
 
293 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0127865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1707  UV damage repair endonuclease  26.89 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1816  UV damage repair endonuclease  27.31 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1536  UV damage repair endonuclease  27.31 
 
 
364 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6817  UV damage repair endonuclease  29.59 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1694  UV damage repair endonuclease-like protein  27.52 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2319  UV damage repair endonuclease-like protein  29.82 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2133  UV damage repair endonuclease  25.97 
 
 
357 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  0.466844 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0888  hypothetical protein  38.46 
 
 
123 aa  59.3  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0151823  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0795  hypothetical protein  31.25 
 
 
128 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0070553  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3654  UV damage repair endonuclease-like protein  26.97 
 
 
299 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000592118  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1775  hypothetical protein  32.86 
 
 
57 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000133943  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  30.23 
 
 
317 aa  43.9  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>