48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2319 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2319  UV damage repair endonuclease-like protein  100 
 
 		 312 aa  618  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1694  UV damage repair endonuclease-like protein  76.6 
 
 		 313 aa  411  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3654  UV damage repair endonuclease-like protein  44.79 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2424  UV-endonuclease UvdE  36.36 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0383  UV damage repair endonuclease-like protein  36.01 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0127865  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2026  UV-endonuclease UvdE  36.52 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200241  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1722  putative UV damage endonuclease  30.3 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09690  UV-damage endonuclease  28.26 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2043  putative UV damage endonuclease  25.19 
 
 		 412 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2329  putative UV damage endonuclease  25 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.385133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5061  putative UV damage endonuclease  26.79 
 
 		 320 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5482  putative UV damage endonuclease  26.32 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00076695  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  30.97 
 
 		 420 aa  96.3  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.295167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0263  putative UV damage endonuclease  26.42 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5145  putative UV damage endonuclease  26.24 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0226  putative UV damage endonuclease  26.22 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0222  putative UV damage endonuclease  26.67 
 
 		 320 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0282  putative UV damage endonuclease  26.67 
 
 		 320 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1671  putative UV damage endonuclease  30.63 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00771336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0268  putative UV damage endonuclease  26.04 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0174  putative UV damage endonuclease  32.05 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5470  putative UV damage endonuclease  25.94 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000392021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0248  putative UV damage endonuclease  25.66 
 
 		 320 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0261  putative UV damage endonuclease  25.66 
 
 		 320 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0234  putative UV damage endonuclease  25.66 
 
 		 320 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0220  putative UV damage endonuclease  25.66 
 
 		 320 aa  89  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5440  putative UV damage endonuclease  24.34 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5196  putative UV damage endonuclease  23.97 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5047  putative UV damage endonuclease  23.97 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.43469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2305  UV-endonuclease UvdE  30.42 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5031  putative UV damage endonuclease  23.95 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5592  putative UV damage endonuclease  23.97 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5525  putative UV damage endonuclease  23.97 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5478  putative UV damage endonuclease  23.6 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  24.32 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  29.22 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0352  putative UV damage endonuclease  25.48 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3025  putative UV damage endonuclease  24.34 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1346  putative UV damage endonuclease  25.47 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0136  putative UV damage endonuclease  24.88 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03600  conserved hypothetical protein  23.48 
 
 		 612 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.574638  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00604  endonuclease (Eurofung)  21.66 
 
 		 591 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2133  UV damage repair endonuclease  28.25 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  0.466844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4123  putative UV damage endonuclease  23.35 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1707  UV damage repair endonuclease  31.17 
 
 		 363 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1816  UV damage repair endonuclease  28.15 
 
 		 364 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1536  UV damage repair endonuclease  28.15 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6817  UV damage repair endonuclease  27.74 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>