49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4123 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4123  putative UV damage endonuclease  100 
 
 
308 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3025  putative UV damage endonuclease  63.36 
 
 
298 aa  381  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0573  putative UV damage endonuclease  61.99 
 
 
315 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280192  normal  0.431721 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1819  putative UV damage endonuclease  47.22 
 
 
311 aa  270  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.594158 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1346  putative UV damage endonuclease  35.28 
 
 
306 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0174  putative UV damage endonuclease  30.36 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5031  putative UV damage endonuclease  36.36 
 
 
317 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5440  putative UV damage endonuclease  36.36 
 
 
325 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5196  putative UV damage endonuclease  36.36 
 
 
325 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5047  putative UV damage endonuclease  31.08 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.43469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5478  putative UV damage endonuclease  35.35 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09690  UV-damage endonuclease  29.51 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5592  putative UV damage endonuclease  35.86 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5145  putative UV damage endonuclease  31.34 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5470  putative UV damage endonuclease  31.45 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000392021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5482  putative UV damage endonuclease  30.99 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00076695  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5525  putative UV damage endonuclease  30.3 
 
 
325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  37.43 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  31.11 
 
 
420 aa  113  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.295167 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1722  putative UV damage endonuclease  30.51 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2305  UV-endonuclease UvdE  30.03 
 
 
297 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0352  putative UV damage endonuclease  29.22 
 
 
320 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0282  putative UV damage endonuclease  30.48 
 
 
320 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0263  putative UV damage endonuclease  30.48 
 
 
320 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0268  putative UV damage endonuclease  30.11 
 
 
320 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2329  putative UV damage endonuclease  27.36 
 
 
412 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.385133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0222  putative UV damage endonuclease  30.11 
 
 
320 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00604  endonuclease (Eurofung)  34.51 
 
 
591 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0234  putative UV damage endonuclease  30.11 
 
 
320 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0220  putative UV damage endonuclease  30.11 
 
 
320 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0248  putative UV damage endonuclease  30.11 
 
 
320 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5061  putative UV damage endonuclease  30.11 
 
 
320 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0261  putative UV damage endonuclease  30.11 
 
 
320 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2043  putative UV damage endonuclease  27.03 
 
 
412 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2026  UV-endonuclease UvdE  30.54 
 
 
311 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  26.62 
 
 
321 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2424  UV-endonuclease UvdE  28.67 
 
 
353 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0136  putative UV damage endonuclease  31.43 
 
 
225 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0226  putative UV damage endonuclease  28.36 
 
 
320 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03600  conserved hypothetical protein  29.64 
 
 
612 aa  96.7  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.574638  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1671  putative UV damage endonuclease  25.71 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00771336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1816  UV damage repair endonuclease  25.19 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1536  UV damage repair endonuclease  25.19 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1707  UV damage repair endonuclease  24.53 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6817  UV damage repair endonuclease  28.95 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2133  UV damage repair endonuclease  25.3 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  0.466844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0383  UV damage repair endonuclease-like protein  28.82 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0127865  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3654  UV damage repair endonuclease-like protein  26.3 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000592118  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1694  UV damage repair endonuclease-like protein  24.88 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>