50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2305 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2305  UV-endonuclease UvdE  100 
 
 		 297 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03600  conserved hypothetical protein  36.51 
 
 		 612 aa  144  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.574638  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0174  putative UV damage endonuclease  35.31 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00604  endonuclease (Eurofung)  34.77 
 
 		 591 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1722  putative UV damage endonuclease  33.11 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1346  putative UV damage endonuclease  36.8 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0352  putative UV damage endonuclease  31 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2329  putative UV damage endonuclease  29.93 
 
 		 412 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.385133  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1671  putative UV damage endonuclease  30.23 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00771336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09690  UV-damage endonuclease  28.53 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2043  putative UV damage endonuclease  29.61 
 
 		 412 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5482  putative UV damage endonuclease  29.96 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00076695  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2424  UV-endonuclease UvdE  33.69 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5145  putative UV damage endonuclease  30.37 
 
 		 317 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  32.77 
 
 		 420 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.295167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5470  putative UV damage endonuclease  29.21 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000392021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5440  putative UV damage endonuclease  28.94 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5031  putative UV damage endonuclease  28.94 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5196  putative UV damage endonuclease  28.57 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5047  putative UV damage endonuclease  28.57 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.43469  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2026  UV-endonuclease UvdE  31.78 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5478  putative UV damage endonuclease  28.57 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5592  putative UV damage endonuclease  28.21 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5525  putative UV damage endonuclease  28.57 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  27.34 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0222  putative UV damage endonuclease  27.11 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0234  putative UV damage endonuclease  27.11 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0248  putative UV damage endonuclease  27.11 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0261  putative UV damage endonuclease  27.11 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0220  putative UV damage endonuclease  27.11 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5061  putative UV damage endonuclease  27.68 
 
 		 320 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0226  putative UV damage endonuclease  25.99 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0282  putative UV damage endonuclease  27.11 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4123  putative UV damage endonuclease  30.03 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0268  putative UV damage endonuclease  26.74 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0263  putative UV damage endonuclease  26.37 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0136  putative UV damage endonuclease  34.35 
 
 		 225 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  26.01 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3025  putative UV damage endonuclease  28.8 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0573  putative UV damage endonuclease  29.51 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280192  normal  0.431721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1707  UV damage repair endonuclease  31.34 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6817  UV damage repair endonuclease  29.7 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1536  UV damage repair endonuclease  30.85 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1816  UV damage repair endonuclease  30.85 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0383  UV damage repair endonuclease-like protein  30.67 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0127865  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2133  UV damage repair endonuclease  29.85 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  0.466844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1694  UV damage repair endonuclease-like protein  33 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2319  UV damage repair endonuclease-like protein  34.3 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3654  UV damage repair endonuclease-like protein  27.72 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1819  putative UV damage endonuclease  27.92 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.594158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>