50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0174 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0174  putative UV damage endonuclease  100 
 
 		 296 aa  610  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1346  putative UV damage endonuclease  54.03 
 
 		 306 aa  345  7e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0136  putative UV damage endonuclease  62.16 
 
 		 225 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09690  UV-damage endonuclease  34.1 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1722  putative UV damage endonuclease  40.91 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0352  putative UV damage endonuclease  32.37 
 
 		 320 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5047  putative UV damage endonuclease  31.73 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.43469  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00604  endonuclease (Eurofung)  36.82 
 
 		 591 aa  153  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5145  putative UV damage endonuclease  31.19 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5031  putative UV damage endonuclease  31.09 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5196  putative UV damage endonuclease  31.41 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5440  putative UV damage endonuclease  31.41 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03600  conserved hypothetical protein  39.67 
 
 		 612 aa  149  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.574638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5478  putative UV damage endonuclease  30.45 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5470  putative UV damage endonuclease  32.4 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000392021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5482  putative UV damage endonuclease  31.73 
 
 		 317 aa  148  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00076695  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5525  putative UV damage endonuclease  30.13 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5592  putative UV damage endonuclease  31.09 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  30.8 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2305  UV-endonuclease UvdE  35.31 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0261  putative UV damage endonuclease  33.1 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0234  putative UV damage endonuclease  33.1 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0220  putative UV damage endonuclease  33.1 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0248  putative UV damage endonuclease  33.1 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0282  putative UV damage endonuclease  33.1 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0268  putative UV damage endonuclease  32.75 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0222  putative UV damage endonuclease  33.1 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5061  putative UV damage endonuclease  32.75 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0263  putative UV damage endonuclease  32.75 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0226  putative UV damage endonuclease  32.4 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2026  UV-endonuclease UvdE  38.06 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200241  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1671  putative UV damage endonuclease  34.34 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00771336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2424  UV-endonuclease UvdE  35.09 
 
 		 353 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3025  putative UV damage endonuclease  30.07 
 
 		 298 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0573  putative UV damage endonuclease  30 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280192  normal  0.431721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4123  putative UV damage endonuclease  30.36 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2329  putative UV damage endonuclease  26.89 
 
 		 412 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.385133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2043  putative UV damage endonuclease  28.1 
 
 		 412 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  40.33 
 
 		 420 aa  115  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.295167 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  29.53 
 
 		 418 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1819  putative UV damage endonuclease  32.34 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.594158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6817  UV damage repair endonuclease  28.08 
 
 		 355 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2133  UV damage repair endonuclease  27.65 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  0.466844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1816  UV damage repair endonuclease  26.55 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1536  UV damage repair endonuclease  26.55 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0383  UV damage repair endonuclease-like protein  28.21 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0127865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2319  UV damage repair endonuclease-like protein  32.28 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1707  UV damage repair endonuclease  25.45 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1694  UV damage repair endonuclease-like protein  28.47 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3654  UV damage repair endonuclease-like protein  29.69 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000592118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>