50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3025 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3025  putative UV damage endonuclease  100 
 
 
298 aa  614  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4123  putative UV damage endonuclease  63.36 
 
 
308 aa  381  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0573  putative UV damage endonuclease  55.21 
 
 
315 aa  335  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280192  normal  0.431721 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1819  putative UV damage endonuclease  45.83 
 
 
311 aa  255  7e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.594158 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1346  putative UV damage endonuclease  31.61 
 
 
306 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0174  putative UV damage endonuclease  30.07 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5440  putative UV damage endonuclease  29.41 
 
 
325 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5196  putative UV damage endonuclease  28.72 
 
 
325 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5031  putative UV damage endonuclease  28.72 
 
 
317 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5047  putative UV damage endonuclease  28.37 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.43469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5145  putative UV damage endonuclease  28.83 
 
 
317 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5482  putative UV damage endonuclease  28.72 
 
 
317 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00076695  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5478  putative UV damage endonuclease  29.79 
 
 
317 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5470  putative UV damage endonuclease  29.08 
 
 
317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000392021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5525  putative UV damage endonuclease  29.41 
 
 
325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5592  putative UV damage endonuclease  28.37 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09690  UV-damage endonuclease  26.82 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  32 
 
 
420 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.295167 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1722  putative UV damage endonuclease  31.78 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2026  UV-endonuclease UvdE  30.99 
 
 
311 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  26.86 
 
 
321 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  30.45 
 
 
418 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0226  putative UV damage endonuclease  26.76 
 
 
320 aa  99  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0268  putative UV damage endonuclease  25.95 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0282  putative UV damage endonuclease  25.52 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0136  putative UV damage endonuclease  32.09 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0261  putative UV damage endonuclease  25.95 
 
 
320 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0248  putative UV damage endonuclease  25.95 
 
 
320 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0222  putative UV damage endonuclease  25.52 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0220  putative UV damage endonuclease  25.95 
 
 
320 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0234  putative UV damage endonuclease  25.95 
 
 
320 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0263  putative UV damage endonuclease  27.94 
 
 
320 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5061  putative UV damage endonuclease  27.49 
 
 
320 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2305  UV-endonuclease UvdE  28.8 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00604  endonuclease (Eurofung)  28.83 
 
 
591 aa  96.3  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0352  putative UV damage endonuclease  25 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2424  UV-endonuclease UvdE  31.43 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1671  putative UV damage endonuclease  31.84 
 
 
321 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00771336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2043  putative UV damage endonuclease  25.41 
 
 
412 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2329  putative UV damage endonuclease  26.07 
 
 
412 aa  85.9  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.385133  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03600  conserved hypothetical protein  24.8 
 
 
612 aa  82  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.574638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1707  UV damage repair endonuclease  25.86 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6817  UV damage repair endonuclease  25.96 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1816  UV damage repair endonuclease  25.35 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1536  UV damage repair endonuclease  25.35 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3654  UV damage repair endonuclease-like protein  27.47 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000592118  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2133  UV damage repair endonuclease  24.07 
 
 
357 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  0.466844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0383  UV damage repair endonuclease-like protein  28.88 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0127865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2319  UV damage repair endonuclease-like protein  25.62 
 
 
312 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1694  UV damage repair endonuclease-like protein  25.88 
 
 
313 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>