39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1689 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  88 
 
 		 276 aa  508  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  85.87 
 
 		 283 aa  493  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  83.64 
 
 		 275 aa  479  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.88 
 
 		 276 aa  335  5.999999999999999e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  56.27 
 
 		 279 aa  325  6e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  52.35 
 
 		 276 aa  311  7.999999999999999e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  35.53 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  35.34 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.17 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  34.81 
 
 		 279 aa  155  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  31.47 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  35.23 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  34.05 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  34.05 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  34.05 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  32.73 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.71 
 
 		 286 aa  135  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.67 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  31.87 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  31.87 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  30.36 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.14 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  30.69 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  30.69 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  31.84 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  31.82 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.74 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  26.56 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  23.9 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  27.73 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  24.02 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  29.27 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  24.79 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  26.05 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  23.08 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  24.32 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  24.4 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.75 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>