50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1641 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 273 aa  559  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  66.54 
 
 		 272 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  66.54 
 
 		 272 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  40 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  40.36 
 
 		 273 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  40.36 
 
 		 273 aa  208  8e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  39.29 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  42.86 
 
 		 276 aa  205  6e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  40.15 
 
 		 291 aa  204  9e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  38.73 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  39.86 
 
 		 279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  41.79 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  38.63 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.91 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  42.06 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  30.22 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  32.41 
 
 		 292 aa  125  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  29.14 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  30.74 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  28.16 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  26.98 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.21 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  31.13 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.13 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  28.42 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  30.12 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.59 
 
 		 288 aa  95.5  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  30.13 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.17 
 
 		 334 aa  89.4  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  26.38 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  28.1 
 
 		 289 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0264  apurinic endonuclease Apn1  25.14 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  24.39 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  29.69 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  28.41 
 
 		 280 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  25.82 
 
 		 277 aa  45.4  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  25.9 
 
 		 282 aa  45.4  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  31.4 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  26.99 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  29.41 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  28.78 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  28.95 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  28.35 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  31.36 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  27.92 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  26.12 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  28.08 
 
 		 284 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  28.38 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  24.24 
 
 		 293 aa  42.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  24.89 
 
 		 297 aa  42  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>