40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1781 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  100 
 
 		 275 aa  568  1e-161  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  84.73 
 
 		 276 aa  487  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  83.64 
 
 		 280 aa  479  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  81.09 
 
 		 283 aa  463  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  54.48 
 
 		 279 aa  321  9.999999999999999e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.99 
 
 		 276 aa  315  7e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  50.36 
 
 		 276 aa  285  5e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  34.07 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  34.69 
 
 		 279 aa  149  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  35.36 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  32.73 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.93 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  31.56 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  32.85 
 
 		 276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  32.25 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.86 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  31.52 
 
 		 273 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.25 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  31.14 
 
 		 276 aa  125  9e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  30.91 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  31.47 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.98 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  31.05 
 
 		 250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  33.47 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.57 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  28.72 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  28.72 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  28.63 
 
 		 315 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  23.92 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  28.43 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  23.72 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  27.5 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  25.51 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  26.09 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  27.42 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.23 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  38.57 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  21.54 
 
 		 289 aa  42  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  24 
 
 		 279 aa  42  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>