55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0729 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  100 
 
 		 276 aa  564  1e-160  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  74.18 
 
 		 276 aa  423  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  52.35 
 
 		 280 aa  311  7.999999999999999e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  50.36 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  49.28 
 
 		 283 aa  290  1e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  48.73 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  50.36 
 
 		 275 aa  285  5e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  36.43 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  39.7 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.46 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  34.43 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  35 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  34.17 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  32.97 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  32.62 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  35.61 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.37 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  35.25 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  33.81 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  31.49 
 
 		 292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  31.62 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.74 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.3 
 
 		 334 aa  123  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  31.45 
 
 		 272 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  31.45 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  30.71 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.82 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  28.69 
 
 		 315 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  26.37 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  24.79 
 
 		 289 aa  48.9  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  26.63 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  24.17 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  24.02 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  25.24 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  26.83 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0680  apurinic endonuclease Apn1  25.68 
 
 		 253 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  22.43 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  23.53 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  24.29 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  30.33 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0264  apurinic endonuclease Apn1  29.94 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  23.53 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  26.03 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  25.5 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  25.5 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  25.75 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  25.5 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  24.81 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  26.73 
 
 		 463 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  25.35 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  26.44 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  31.25 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  22.67 
 
 		 282 aa  42  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>