110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1518 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55 
 
 		 288 aa  350  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  56.99 
 
 		 284 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.72 
 
 		 286 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  49.65 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  37.5 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  33.82 
 
 		 298 aa  175  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  36.26 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.97 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  32.94 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  31.75 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  32.14 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  31.47 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.34 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  31.29 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  31.67 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  33.6 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  33.6 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  33.58 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  29.83 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  31.56 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  31.91 
 
 		 273 aa  136  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  31.49 
 
 		 276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  31.91 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  31.91 
 
 		 273 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  29.38 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.41 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.58 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  26.67 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  26.4 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  24.77 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  26.75 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  27.61 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  23.61 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  23.61 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  27.16 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  29.33 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  28.04 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  25.26 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  24.12 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  24.35 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  24.79 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  27.57 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  26.09 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  25.09 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4666  endonuclease IV  27.54 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  29.84 
 
 		 379 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  23.18 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  26.86 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  27.78 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  27.42 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  30.26 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  25.62 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  24.15 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  26.25 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  25.27 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  24.12 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  24.68 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  20.67 
 
 		 277 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  25.83 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  23.08 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1532  endonuclease IV  22.73 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212021  normal  0.133835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2756  endonuclease IV  22.73 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0855606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  27.33 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  21.65 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  28.32 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  23.88 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  25.42 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  24 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  21.79 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.99 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  24.86 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  24.86 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  21.79 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  22.1 
 
 		 277 aa  46.6  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  24.86 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  24.86 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  22.8 
 
 		 277 aa  46.6  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  23.73 
 
 		 250 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2675  endonuclease IV  22.73 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  22.78 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  24.86 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  24.86 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  25 
 
 		 280 aa  46.2  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  24.39 
 
 		 463 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  24.74 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  24.7 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  24.29 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl333  endonuclease IV  23.46 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144036  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  24.29 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  23.76 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  22.83 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  21.52 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  23.46 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  24.68 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  26.42 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  24.08 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  25.12 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  24.26 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>