62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2015 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  100 
 
 		 298 aa  616  1e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  57.66 
 
 		 279 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.98 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  47.99 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  47.99 
 
 		 276 aa  271  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  45.02 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  42.24 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  44.04 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  46.96 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  42.24 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  41.88 
 
 		 273 aa  239  4e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  41.16 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  39.71 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  39.71 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.63 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  33.82 
 
 		 292 aa  175  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  35.61 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.46 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  34.43 
 
 		 276 aa  162  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  35.34 
 
 		 280 aa  159  7e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  35.61 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  35.36 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  33.69 
 
 		 279 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.13 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  35.36 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  34.3 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.32 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  33.33 
 
 		 315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.92 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  32.52 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  30.06 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  30.06 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  27.17 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  27.32 
 
 		 283 aa  53.9  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  22.87 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  30.86 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  30.86 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  25.78 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  30.86 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  30.86 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  25.85 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  30.86 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  30.86 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  29.81 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  29.19 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  29.19 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  29.88 
 
 		 250 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  24.61 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  29.27 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  23.98 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  25.64 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  29.71 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  23.72 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  24.85 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  21.66 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  25.15 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.08 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  26.95 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  22.51 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  22.08 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  23.29 
 
 		 259 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  23.5 
 
 		 282 aa  42.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>