142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1146 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  99.63 
 
 		 272 aa  542  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  100 
 
 		 272 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  66.54 
 
 		 273 aa  381  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  43.77 
 
 		 273 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  43.42 
 
 		 273 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  43.93 
 
 		 273 aa  222  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  43.06 
 
 		 273 aa  222  4e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  41.9 
 
 		 276 aa  219  5e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  39.71 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  43.17 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  42.45 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  40.15 
 
 		 291 aa  208  7e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  39.64 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.27 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  42.4 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  33.6 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  31.29 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.18 
 
 		 286 aa  135  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.35 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  30.69 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.14 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  31.45 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  30.32 
 
 		 276 aa  125  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  29.75 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  31.29 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  29.92 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  28.72 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.87 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  29.2 
 
 		 315 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  29.15 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  27.74 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  28.82 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  25.49 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  28.49 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  27.65 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  27.59 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  27.39 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  23.21 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  31.21 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  29.09 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  24.72 
 
 		 326 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  25 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  28.11 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  28.93 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  26.62 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  28.39 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  26.28 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  23.11 
 
 		 282 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  24.85 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  31.71 
 
 		 282 aa  52.4  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  26.28 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  27.04 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  25.61 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  29.59 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  30.38 
 
 		 544 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  27.1 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  27.1 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  26.51 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  27.1 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  27.36 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  27.36 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  28.85 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  27.1 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  29.09 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  27.74 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  27.36 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0264  apurinic endonuclease Apn1  28.7 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  27.36 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  27.1 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  26.9 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  26.9 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  27.36 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  27.1 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  30.08 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  25.44 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  27.66 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  27.36 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  25 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  26.9 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  28.85 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  30.08 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  28.1 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  27.36 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  28.12 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  26.9 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  26.87 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  24.57 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  25.16 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  27.27 
 
 		 285 aa  49.3  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  25.41 
 
 		 275 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  26.62 
 
 		 293 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  26.87 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  27.74 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  26.83 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  26.45 
 
 		 298 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  26.45 
 
 		 298 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  25.41 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  29.09 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  25.81 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  26.9 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>