44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0994 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  94.87 
 
 		 273 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  90.84 
 
 		 273 aa  501  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  74.73 
 
 		 273 aa  412  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  66.3 
 
 		 276 aa  374  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.53 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  45.32 
 
 		 279 aa  248  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  42.24 
 
 		 298 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  44.24 
 
 		 276 aa  235  7e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  43.88 
 
 		 276 aa  229  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  43.77 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  43.42 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  44.31 
 
 		 250 aa  211  9e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  38.55 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.36 
 
 		 273 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.04 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  34.05 
 
 		 280 aa  145  5e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  35.61 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  35 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.17 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  33.45 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  31.75 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  33.7 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  33.33 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  31.91 
 
 		 292 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  30.04 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.1 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  30.58 
 
 		 315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.62 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  20.35 
 
 		 293 aa  52.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  27.17 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  21.68 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  24.42 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  21.68 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  23.33 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  26.06 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  25.45 
 
 		 260 aa  45.8  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  20.11 
 
 		 326 aa  45.4  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  23.53 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  25.29 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  23.7 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  24.68 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  22.78 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  25.75 
 
 		 298 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>