99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1981 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  584  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  50 
 
 		 284 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  49.65 
 
 		 292 aa  294  9e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.75 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.49 
 
 		 286 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  34.3 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.64 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  30.6 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  30.04 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  30.39 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  30.82 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  30.45 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  33.21 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  32.61 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  28.62 
 
 		 276 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  32.37 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  31.64 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  32.32 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  33.58 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.2 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  33.33 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  33.58 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  30.65 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  30.65 
 
 		 272 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  34.59 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  32.4 
 
 		 250 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.02 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  33.86 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.23 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  31.15 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  27.81 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  26.38 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  26.67 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  27.89 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  33.95 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  27.22 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  36.05 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  29.96 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  25.91 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  28.3 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  27.27 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  29.82 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2756  endonuclease IV  29.48 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0855606  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  28.93 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  28.25 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2675  endonuclease IV  29.48 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  30.06 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1532  endonuclease IV  29.48 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212021  normal  0.133835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  25.91 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  28.57 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  25.73 
 
 		 283 aa  50.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  25.57 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  30.3 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  27.68 
 
 		 282 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  26.01 
 
 		 282 aa  48.9  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  24.84 
 
 		 379 aa  48.9  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  27.17 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  27.27 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  27.68 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  29.28 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  27.93 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.08 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  27.64 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  30.86 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  27.22 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  27.09 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  28.9 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  29.94 
 
 		 544 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  27.38 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  27.81 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0392  endonuclease IV  25.56 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.907321  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  28.32 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  26.29 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  25 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  23.11 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  28.99 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  25.14 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  26.37 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  28.32 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  26.37 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  28.03 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  23.75 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  29.65 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  27.06 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  23.75 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  29.38 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  26.8 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  27.81 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  29 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  26.92 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  23.98 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl333  endonuclease IV  24.88 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144036  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  25.16 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  26.79 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  22.73 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  26.59 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  26.59 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  24.75 
 
 		 284 aa  42.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  26.37 
 
 		 285 aa  42.4  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>